微生物在其生長繁殖過程中，不斷地從外界環境中吸收營養物質，在體內經過一係列的變化，轉變為細胞本身有用的物質；與此同時，它也不斷地向體外排泄對本身無用的物質，以維持細胞的正常生長和繁殖。這一係列的變化實際上就是各種物質在體內進行化學反應的過程。這種變化在生物學上稱為新陳代謝。
微生物的新陳代謝和其他生物相同，包括合成代謝和分解代謝兩個方麵。合成代謝也稱 同化作用。它是指微生物將營養物質轉變為身體組成成分的過程。微生物吸收營養物進入細胞，然後將它們合成本身需要的新的蛋白質、多糖、核酸等物質。分解代謝也稱異化作用。它是指微生物將自己細胞內的複雜的細胞物質和環境中營養物質分解為簡單的小分子的物質過程。分解代謝是產生能量的反應，所產生的能量可供合成代謝以及其他生命活動的需要。
微生物體內，合成代謝與分解代謝偶聯進行，相互對立而又統一，共 同決定著生命的存在與發展。分解代謝為合成代謝提供能量和原料，為合成代謝 的進行提供了必要的條件，而合成代謝又是分解代謝的基礎，為分解代謝提供基質。因此，研究微生物的新陳代謝的過程，必將更好地幫助我們認識和了解微生物。
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