能抑製、殺死微生物的化學因素種類較多，用途也相當廣泛，主要可以分為表麵消毒劑、防腐劑、化學治療劑。
1、化學表麵消毒劑
凡是用於殺死微生物的化學藥品都稱為化學消毒劑，種類較多，主要如下：
（1）乙醇 殺菌機理是其脫水作用、溶解細胞膜脂和進人蛋白質的肽鍵空問結構，引起蛋白質變性。70%~75％是乙醇消毒的最佳濃度。主要用於物體的表麵和皮膚的消毒。
（2）甲醛 殺菌機理是它能破壞蛋白質的氫鍵，並能與氨基結合，從而造成蛋白質變性。殺菌效果較好，對營養體和孢子都有作用。工廠和實驗室常采用甲醛熏蒸進行空間消毒。
（3）來蘇兒（2%煤酚皂） 石炭酸（苯酚）能使蛋白質變性，並能損傷細胞膜，因而是較好的消毒劑。石炭酸的水溶性較差，通常將它與皂液和煤油混合，增加其溶解度，這種混合液稱為來蘇兒。常用於物體表麵、地麵和皮膚等消毒。
（4）過氧化氫 3%的過氧化氫也是一種皮膚傷口消毒劑。殺菌機理是利用其氧化性使蛋白質活性基團被氧化而失活。
（5）過氧乙酸 是一種高效、速效、廣譜和無毒的化學殺菌劑。0.001%濃度的過氧乙酸水溶液能在10min內殺死大腸杆菌。適用手塑料、玻璃製品、棉布、人造纖維等製品的消毒，也適用於果蔬和雞蛋等食品表麵的消毒。
（6）紅汞 屬於重金屬，它能與蛋白質的巰基結合，使蛋白質變性失活。醫學上常用於皮膚傷口的消毒。
（7）硝酸銀 屬重金屬，能造成蛋白質變性沉澱。醫學上用於皮膚和眼睛等部位的消毒。
（8）氯、次氯酸鈉、漂白粉（次氛酸鈣） 殺菌機理是它們的氧化性破壞細胞膜和酶蛋白的結構，從而造成菌體死亡。可用於環境消毒和空間消毒。
(9）二氧化氯殺菌能力強、效果持續時間長和用量省，尤其是水體經其消毒後，不會殘留有毒物質。廣泛用於生活用水和汙水的消毒處理，也適用於食品加工和養殖業中的消毒、滅菌、防腐、保鮮、除臭和漂白等。
（10）碘酒2.5%的碘溶解於酒精中，可做皮膚消毒劑。其殺菌機理是利用碘與蛋白質中的酪氨酸發生鹵化反應，而使蛋白質失活。
（11）新潔而滅 新潔而滅是季胺類，屬陽離子表麵活性劑亡。對微生物的營養細胞有殺滅作用，但對芽孢杆菌僅有抑製作用。它與菌體表麵結合，破壞膜結構，並能使蛋白變性。其稀溶液對人體無刺激，不汙染衣物，性質較穩定，易於保存，應用較廣，以0.01%做創麵消森，以0.1%做皮膚和器械等的消毒。
（12）龍膽紫（結晶紫染料） 結晶紫染料能與蛋白質的羧基結合，造成蛋白變性，達到殺菌的目的。2%～4%的結晶紫溶液也是較好的皮膚傷口消毒劑。
（13）硫磺粉 硫磺燃燒產生SO2，S02與水結合形成H2SO3，在菌體表麵奪取氧成為H2SO4，從而致使菌體脫氧死亡。常用於廠區消毒。
2、防腐劑
防腐是利用物理和化學的手段，完全抑製黴腐微生物的生長繁殖，防止食品等發生黴變的措施。此時，微生物並沒有被殺滅，而隻是妥到抑製。用於抑製體外微生物生長的化學藥品稱為防腐劑，實際上，小劑量的消毒劑也就是防腐劑。如醬油中的苯甲酸鈉，飲料和化妝品中的山梨酸鈉都是良好的防腐劑。
3、化學治療劑
利用具高度選擇毒力的化學物質來抑製宿主體內病原微生物的生長繁殖，甚至殺滅，達到治療疾病的目的。主要有抗代謝類藥物、抗生素和中草藥等。
（1）抗代謝類藥物
有些化合物在結構上與生物體所必需的代謝物很相似，以至於可以和特定的酶結合，從而阻礙酶的功能，幹擾代謝的正常進行，這些物質稱為抗代謝物。若用於疾病的治療，可以稱為抗代謝類藥物。磺胺類藥物是典型的抗代謝類藥物
（2）抗生素
抗生素是許多生物的生命活動過程中產生的一類次級代謝產物或其人工衍生物，它們在很低濃度時就能抑製或影響其他種類生物的生命活動。抗生素可通過抑製細胞壁的合成、改變細胞膜的通透性、抑製蛋白質或核酸的合成等反應機理抑製或殺死微生物。
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