液體培養就是將微生物接種到液體培養基中進行培養。由於大多數發酵微生物是好氧性的，而且微生物隻能利用溶解氧，所以如何保證培養液中有較高的溶解氧濃度至關重要。在實驗室進行好氧菌液體培養的方法主要有四類：
1.試管液體培養 此法的通氣效果一般較差，僅適用於培養兼性厭氧菌，以及進行微生物的各種生理生化試驗。
2.淺層液體培養 在三角燒瓶中裝入淺層培養液，且通氣量與裝液量、棉塞通氣程度密切相關。通氣量對微生物的生長速度和生長量有很大關係，該方法一般僅適於兼性厭氧菌。
3.搖瓶培養 將裝有液體培養基的三角瓶（搖瓶），上蓋8~12層紗布或用輸送的棉塞塞住以阻止空氣中雜菌或雜質進入瓶內，而空氣可以透過棉塞供微生物呼吸之用。為使菌體獲得充足的氧，一般裝液量為三角瓶的10%以下。有時為提高攪拌效果，增加通氣量，也可在三角瓶內設置擋板或添加玻璃珠等。將搖瓶放在搖瓶機上以一定速度保溫震蕩培養。此法在實驗室廣泛用於微生物的生理生化試驗、發酵和菌種篩選等，發酵工業中用於種子培養。
4.台式發酵罐 實驗室用的發酵罐一般為幾升到幾十升。商品發酵罐的種類很多，一般都有多種自動控製和記錄裝置。如配置有pH、溶解氧、溫度和泡沫檢測電極，有加熱或冷卻裝置，有補料、消泡和pH調節作用的酸或堿儲罐及自動記錄裝置，甚至計算機控製。
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