食用菌雖然美味可口，但野生食用菌常受到季節、場所等條件的影響，所能獲得的量無法滿足人們的需要。經過研究，現在已有不少品種可以人工栽培。食用菌的人工栽培一般是通過播種菌種進行的，包括兩個步驟：第一，培養菌種，即通過采收孢子或從菇體組織中分離出培養食用菌的菌絲體，並加以擴大繁殖。食用菌的菌種一般分為3級：母種、原種和栽培種。人們把剛從孢子分離得到的，或剛從組織分離得到的菌絲體稱為母種。母種的培養基要求營養豐富，含易被菌絲吸收的物質，常用的母種培養基是馬鈴薯汁一蔗糖一瓊脂培養基。母種培養完成後，經擴大繁殖即成原種。原種的培養基是由草類或木屑等材料配製而成。由原種繁殖成的菌種稱為栽培種，栽培種（原種也可）是直接用於生產的播種材料。第二，長成子實體。將繁殖好的菌種接種於草類或木屑等培養基質上，以培植食用菌的子實體。能用於栽培種的培養基的原料有上百種，如稻草、麥秸、鋸末、甘蔗渣和木條等。這些原料一般還添加人畜糞尿、KCL和MgSO4等以滿足菌種對無機元素的需要。下麵以蘑菇為例，簡單介紹食用菌的栽培技術。
蘑菇在我國一般用糞草堆製的廄肥（又稱培養料 ）栽培。草料一般選用稻草和麥稈。它是蘑菇生長的主要碳源 。糞肥可取用豬、牛、馬等動物糞便，作為蘑菇生長所需氮源的主要原料。
糞草必須先經漚製，通過上堆發酵，使嗜熱性纖維分解菌進行活動，將部分複雜物質分解，同時發酵時所產生的高熱又能殺死糞草中的病菌和蟲卵。糞草一般按6：4的比例，以一層草一層糞的形式層層堆積起來（另需加水，使草、糞飽吸水分 ），直至高1m。5—7天後進行一次翻堆，以利發酵均勻。翻堆2—4次後，草莖已柔軟，呈醬色，這時即可進房消毒播種。培養料進房後一般都平鋪在層層相疊的床架上（厚15—20cm），稱床栽。但國外已改用箱栽，有利於蘑菇栽培的機械化、自動化。
蘑菇用菌苗進行播種，常用塊狀穴播法，即在稍加壓緊平整的培養料上，每隔20cm挖一淺穴，約3cm深。隨後將菌種平分成30—40塊，每穴埋植菌種一塊。在22—26攝氏度下，蘑菇菌絲在糞草培養料上蔓延生長。2周後即可在培養料上覆蓋一層黏土土粒（稱覆土），約 3 cm厚。土粒含水量36—40%，以手捏能成形，但不黏手為度。
覆土的蘑菇房溫度需下降到15—18攝氏度。2周後，蘑菇菌絲體在土粒間相互扭結成團，並進一步發育成蘑菇子實體。待菌蓋直徑長到2—4cm大小時即可采收。由於蘑菇一旦開傘，其風味大損，所以采收一定要在開傘前進行。
由於人工栽培蘑菇需要大麵積的菌床，而且單位麵積的蘑菇產量亦不高，生長周期又長，所以有人借助於抗生素的深層液體發酵技術，用深層液體發酵法培養食用菌。這種方法可以使食用菌從農業生產跨進工業生產的領域，能夠在短期內得到大量的食用菌菌絲體及其代謝產物。
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