已經從鏈黴菌分離得到的核苷類抗生素有200多種，它們的活性和作用方式各不相同，隻有少數已應用於農業上。如殺稻瘟素（Blasticidin）S可以防止水稻稻瘟病的發生，由S.griseochromogenes產生；多氧菌素（Polyoxins）對植物病原體具有廣譜抗真菌功能，由S.cacaoi產生。
不屬於以上類型但由鏈黴菌生產的其他重要抗生素及生物活性物質還有：氯黴素（Chloramphenicol），屬於芳香胺-醇化合物，是少數幾種含硝基的天然化合物之一。氯黴素具有廣譜抗菌活性，特別是對革蘭陰性菌的抗菌效果更好，由 S.venezuelae產生。林可黴素（Lincomycin）分子由一個脯氨酸衍生物與一個改性的糖分子結合而成，其生物活性與紅黴素類似，由S.lincolnesis發酵生產。新生黴素（Novobiocin）的分子結構很複雜，含有一個香豆素、一個糖基和一個苯甲酸衍生物，臨床上用作抗葡萄球菌，但主要用於獸藥。新生黴素由S.niveus生產。磷黴素（Posfomycin）是肽葡聚糖合成的抑製劑，對革蘭陽性和陰性菌都有抗菌活性，有好幾種鏈黴菌都能用於生產磷黴素，典型的有S.fradiae。FK506的分子結構中含有一個23元的內脂環，結構複雜，是一種免疫抑製劑，由S.tsukubaensis 產生。米多黴素（mildiomycin）是1978年由日本的Takashi Iwasa等人從一株龜裂鏈輪絲菌（Streploverticillium rimo faciens B-98891）的次級代謝產物中分離得到的一種新型核苷類抗生素，屬於抗真菌類抗生素，對白粉菌有強烈的抑製或殺滅作用，而且對人類及魚類的毒性很小，已經商品化生產。
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