與傳統細胞培養不同,一方麵重組菌存在質粒丟失傾向,另一方麵,由於質粒或宿主細胞的突變,即使質粒沒有丟失,也會發生目標蛋白無法表達的問題。而且不含質粒、少含質粒或含有不表達質粒的細胞生長速率將明顯高於含質粒、含質粒數量多和質粒能表達目標產物的細胞。因此,隨著培養時間增加,不含質粒的宿主菌比例將會越來越高,最終將嚴重影響目的基因的表達效率。提高工程菌的質粒穩定性需要從質粒構建和培養方法改進兩條途徑進行。
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