經過30多年的發展，基因重組已成為一項最基本的基因操作技術，在生命科學研究中發揮了極其重要的作用。同時，基因工程技術自它誕生之日起，就以應用作為研究目標，以新型蛋白質類藥物的研究開發為重點，政府、企業、大學和研究單位投入了大量的人力和物力用於基因工程的應用研究，而且在世界範圍內展開了激烈的競爭。今天，基因工程的研究開發水平已經成了反映一個國家競爭力的重要指標，並將對世界經濟的可持續發展、人們生活水平和生活質量的提高及解決人類所麵臨的許多重大問題產生深遠的影響。
我國對基因工程的研究和開發也十分重視，自20世紀70年代末以來，一直將基因工程作為生物科學與技術領域研究、開發和產業化的重點，組織了大量的基礎研究和科技攻關項目，促使我國在基因工程研究和應用領域迅速縮短了與世界先進水平的差距，在基礎研究和產業化方麵都取得了重要進展。
近年來，基因工程已成為生物科學與技術的核心技術，基因工程本身也有了重大的進展和外延。基因工程的宿主細胞已經從微生物發展到植物、動物和人類細胞；基因工程的目的基因已經從單個基因推廣到基因簇，並從基因組學的高度解決目的基因的來源、定位和功能，形成了基因組工程的新學科;從人類基因組和植物、動物、微生物基因組研究獲得的海量信息，開始發展後基因組工程，以便開發利用基因組學的巨大研究成果。生物芯片技術、體細胞克隆技術、基因診斷和基因治療技術等都已經嶄露頭角。這些研究工作的順利開展，將極大地推動人類對生命現象和生命規律的認識，促進人類文明的發展，並為生物技術發展成為21世紀的支柱產業作出重要貢獻。
代謝工程的發展使基因重組技術的應用擴大到了非蛋白質類產物的生產、有機汙染物降解等新的領域，已經在發酵法生產氨基酸、核苷酸、抗生素等微生物高產菌株選育中發揮了重要作用。
總之，基因工程已經成為工業微生物學的重要手段，將為提高微生物發酵產物產量、開發新的發酵產物作出重要貢獻。
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