在進行培養基的配製時，標準或說明書上通常描述為使用蒸餾水或純化水配製，對此有不少人有疑問，那麽這些水有什麽不同的？配製培養基是否可以通用呢？
在《GB/T 6682-2008 分析實驗室用水規格和試驗方法》標準中，將實驗室用水分為了一級水、二級水、三級水三個等級。
一級水：可以用二級水經過適應設備蒸餾或離子交換混合床處理後，再經過0.2μm微孔濾膜過濾來製取，25℃電導率≤0.01mS/m，用於有嚴格要求的分析試驗（如高效液相色譜）。
二級水：可以通過多次蒸餾或離子交換等方法製取，25℃電導率≤0.1mS/m，常用於無機痕量分析等試驗（如原子吸收光譜分析用水）。
三級水：可用蒸餾或離子交換等方法製取，pH5.0-7.5（一級水和二級水純度很高，pH不做要求），25℃電導率≤0.5 mS/m，用於一般化學分析試驗。
在《GB4789.28-2024 食品安全國家標準 食品微生物學檢驗 培養基和試劑的質量要求》標準中，製備培養基用水要求的25℃電導率不超過25μS/cm（即＜2.5mS/m），除此之外，對微生物數量也是有要求的，微生物汙染數量不超過103CFU/mL。可以看出，實驗室一級、二級、三級水電導率都是符合標準中培養基用水的要求，隻要微生物汙染數量不超標，配製一般的微生物培養基完全沒有問題的（水的純度越高越好，但考慮成本和獲取難度，通常用三級水是足夠的）。
注：進行維生素測定培養基的製備時，要求使用二級水以上的標準，且要注意不能受到容器和環境的汙染。維生素測定培養基對水質要求高於一般的培養基，水中不能有維生素的殘留。進行細胞培養使用的培養基的要求也是高於一般的微生物培養基用水，特別是內毒素不能超標。
蒸餾水/雙蒸水/三蒸水等：通過蒸餾的方法獲得，蒸餾次數越多通常代表水的純度越高，實驗室通常使用蒸餾水即可滿足一般微生物培養基的配製要求。
純化水：一般出現在藥典標準中的描述，通常使用離子交換方法製取，25℃時電導率要求不超過5.1μS/cm（即＜0.51mS/m），純度要求高於實驗室三級水和GB4789.28標準中的質量要求，代替蒸餾水配製培養基是沒有問題的。
注：藥典標準要求更高一些，因此在進行藥品的檢驗配製培養基時，通常需要按照藥典標準的純化水要求執行，雖然使用GB4789.28標準中的水製備並不會影響檢驗結果，但這個結果可能不會被認可。
去離子水：通常利用離子交換樹脂除去水中的陽離子和陰離子，電阻率通常＜2μS/cm（即＜0.2mS/m），代替蒸餾水配製培養基也是沒有問題的，但需要注意去離子水中可能會有有機物殘留，確保微生物汙染不會超標。
綜合以上所述，進行一般的微生物培養基配製時，隻要水質的電導率和微生物限度合格，使用蒸餾水、純化水或去離子水配製培養基都是可以的。若使用的水質不佳，可能會導致一些培養基滅菌後呈現比較渾濁的狀態，特別是一些含磷酸鹽成分較多的培養基（如磷酸鹽緩衝液），滅菌後可能呈現渾濁或者有沉澱的樣子。另外容器也可能是汙染水質的原因之一，刷洗後的玻璃容器一定要使用蒸餾水充分衝洗幹淨，減少殘留。不可使用自來水、礦泉水配製培養基（含離子較多）。緊急或特殊情況下，可以采購娃哈哈純淨水（注意是純淨水，不要買成礦泉水或者白開水之類的）配製培養基，這個水經過實測非常好用，即使是配製維生素測定培養基也沒問題的。
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