6、農藥
農藥是除草劑、殺蟲劑、殺菌劑等化學製劑的總稱。在一定時期內，農藥的使用加快了農業生產的發展。但也不能忽視，過度地使用農藥給環境保護帶來了危害，不少農藥長期存留在土壤中、空氣裏，引起大範圍汙染，嚴重危及人類健康。目前的農藥大多是有機氯、有機磷、有機氮、有機硫農藥，其中以有機氯農藥危害最大。
微生物降解農藥有兩種方式：一種是以農藥作為碳源和能源或氮源，使農藥降解，如假單胞菌和諾卡氏菌屬中的某些種；另一種是共代謝作用，即微生物從其他化合物獲得碳源和能源後，才能使農藥降解轉化。
已經發現，有一些微生物能夠對農藥進行降解。在能降解農藥的微生物中，細菌主要有假 單胞菌屬、芽孢杆菌屬、產堿杆菌屬、黃杆菌屬和節杆菌屬等，放線菌如諾卡氏菌屬，黴菌中如曲黴屬等。
7、石油類的降解
石油是鏈烷烴、環烷烴、芳香烴以及少量非烴化合物組成的複雜混合物。在芳香烴中，已知有七八種具有致癌作用，尤以3，4一苯並芘致癌作用最強。在自然界淨化石油汙染的綜合因素中，微生物降解起著重要作用。據報道，能降解石油的微生物很多，大約有200種。細菌中有假單胞菌屬、棒杆菌屬、微球菌屬和產堿杆菌屬等，放線菌中主要是諾卡氏菌屬，酵母菌 中主要是解脂假絲酵母和熱帶假絲酵母等，黴菌中有青黴屬、曲黴屬等。此外，藍細菌和綠藻也都能降解多種芳香烴。
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