一、動膠菌屬
動膠菌屬：細胞呈杆狀，（0.5—1）um*（1—3）um，幼齡菌體借端生單鞭毛活潑運動，具莢膜，易形成菌膠團。革蘭染色陰性，無芽孢。化能有機營養型需氧菌，能利用某些糖及氨基酸，不能利用澱粉、肝糖、纖維素、蛋白質等， 不產生色素，需要維生素B12以供生活。在好氧活性汙泥工藝中，動膠菌是活性汙泥工藝中常見的重要杆菌，是形成絮狀活性汙泥貢獻最大的菌種。
二、埃希菌屬
埃希菌屬為腸杆菌科的代表屬。直杆菌，細胞短杆狀，（1.1—1.5）um*（2—6）um（活體）或（0.4—0.7）um*（1.3—3）um（幹燥染色後測量 ）。借周生鞭毛運動或不運動，無芽孢，革蘭染色 陰性。在簡單營養培養基上（如肉湯培養基 ）生長迅速 。在營養瓊脂表麵上，菌落光滑S形 ），菌落白色，低突，閃光，邊圓，整齊，濕潤均勻。兼性厭氧菌，在普通培養基上生長迅速 。可發酵乳糖產酸產氣，有的菌株不產氣。產生吲哚，甲基紅反應（+），VP反應（—），不能利用檸檬酸鹽。在伊紅美藍培養基上菌落呈深藍黑色，有金屬光澤。本屬隻有一種，即大腸埃希菌，簡稱大腸杆菌，常被用作水體被糞便或病原菌汙染的指示菌種，亦為微生物學科研中的常用菌種。廣泛存在於自然界及人與動物的腸道內，少數種具有致病性。
三、棒狀杆菌屬
棒狀杆菌屬：杆狀，直或微彎，常呈一端膨大的棒狀，多數不運動。革蘭染色陽性（老齡菌體易脫色），菌內常染色不均一，有顆粒狀內含物。需氧或兼性厭氧。發酵葡萄糖產酸不產氣。腐生性的棒狀杆菌廣泛存在於自然界，可分解多種有機物。
四、變形杆菌屬
變形杆菌屬：直杆菌，（0.4—0.6）um*（1—3）um，菌體常有不規則的變形呈球狀、絲狀等。革蘭染色陰性，無芽孢，無莢膜，無色素。借周生鞭毛運動。
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