一、藍隱藻屬
藍隱藻屬細胞卵圓形或橢圓形，前端常斜截，略凹陷，後端鈍圓，向腹側彎曲。有兩條不等長的鞭毛。色素體1個，有時2個，周生，盤狀，藍色或藍綠色。
二、隱藻屬
隱藻屬細胞有背腹之分，背部隆起，腹部平直或略凹。腹側有明顯口溝。鞭毛2條， 自口溝伸出，略不等長。色素體2個，葉狀，黃綠色或黃褐色。該屬分布較廣，在有機質豐富的水體裏數量較多。
三、紅胞藻屬
紅胞藻屬細胞側麵呈卵形、橢圓形或紡錘形，略扁平，前端中央凹入，後端窄或漸尖形。具縱溝，口溝不明顯。常具刺絲泡。色素體常為1個，片狀，周生，呈紅色或褐色和橄欖綠色。鞭毛2條，略不等長，常位於前端的一側。具1個蛋白核。
四、素隱藻屬
素隱藻屬細胞形態與 隱藻屬相似。口溝明顯，其周圍具刺絲泡。無色素體。核後位。常具許多副澱粉粒。腐生性營養。
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