預防流感的一般措施，主要是加強自身鍛煉增強免疫力。在流感流行期間應盡量避免人群聚集，必要時應戴口罩。公共場所可用乳酸加熱薰蒸進行空氣消毒。通常每100m3空間可用2—4ml乳酸加10倍水混勻，加熱薰蒸。疫苗接種是預防流感最有效的方法，但必須與當前流行株的型別基本相同，才有特異性預防作用。
流感疫苗有滅活疫苗和減毒活疫苗兩種。目前WHO推薦的滅活疫苗包含甲、乙型和多種亞型流感病毒株的抗原，如WHO推薦的20032004年流感病毒裂解疫苗包含甲/莫斯科/（99H3N2）、甲/新喀裏多尼亞/（99H1N1）、乙/香港/2001三種毒株的抗原。推薦用於成人和6個月以上兒童。滅活疫苗的優點是經皮下注入，可產生大量的lgG，副作用小，適用於年老體弱者。缺點是局部slgA產生少，接種次數多。減毒活疫苗采用鼻咽腔噴霧法接種，操作簡單方便，接種局部產生較多slgA，但副作用大，類似輕症感染。
國內外對流感病毒HA和NA亞單位疫苗及基因工程疫苗正在研製中。
對流感尚無特效藥物，主要是對症治療和預防繼發性細菌感染。抗病毒藥金剛烷胺及其類似物甲基金剛烷胺對甲型流感病毒有一定抑製作用，可用於流感的預防和早期治療。其作用機製主要是抑製病毒的穿入和脫殼。此外，幹擾素滴鼻及中藥板藍根、大青葉等也有一定療效。
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