百日咳鮑特菌簡稱百日咳杆菌，在細菌分類學上屬鮑特菌屬，是引起百日咳的病原菌。其傳染性強，易引起兒童嚴重的細菌性呼吸道傳染病。
百日咳鮑特菌為革蘭陰性、短小卵圓形球杆菌，大小為（0.2—0.5）um*（0.2—0.5）um。無芽孢、無鞭毛，毒力菌株有莢膜和菌毛。營養要求很高，專性需氧，生長過程中需要添加血液或澱粉。初次分離用含甘油、馬鈴薯、血液的鮑-金培養基，35—37℃培養3—5d後形成細小、光滑、隆起、有珠光色澤的菌落，周圍有不明顯的溶血環。新分離菌株為光滑型，有莢膜，稱工相菌，具有菌體（O）和表麵（K）抗原。I相菌有毒力，人工培養後可發生變異，表現為莢膜和菌毛的逐漸消失，形態、菌落、溶血性、抗原結構、致病力等也全麵變異。I、II相為過渡相，IV相即為粗糙型菌落的無毒株。製備菌苗時應選用I相菌株。百日咳鮑特菌的生化反應極不活潑，不發酵任何糖類、不生成硫化氫、不產生吲哚，過氧化氫酶試驗陽性。
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