埃希菌屬有5個種，其中大腸埃希菌是最常見的臨床分離菌。
大腸埃希菌是腸道中重要的正常菌群，嬰兒出生後數小時就進入腸道，並終身伴隨，其能為宿主提供一些具有營養作用的合成代謝產物。當宿主免疫力下降或細菌侵入腸道外組織或器官，即可成為條件致病菌，引起腸外感染，以化膿性感染和泌尿道感染最為常見。有些血清型大腸埃希菌具有致病性，能導致人類腹瀉。
大腸埃希菌在環境衛生和食品衛生學中，常被用作糞便汙染的衛生學檢測指標。在分子生物學和基因工程研究中，大腸埃希菌是重要的實驗材料。
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