（二）血清HBV DNA檢測
血清中存在HBV DNA是診斷HBV感染最直接的證據，可用定性或定量核酸雜交法、定性PCR法、熒光定量PCR法檢測。核酸雜交技術可直接檢測血清中的HBV DNA。熒光定量PCR技術是 目前最敏感的方法。HBV DNA檢測可作為HBsAg陰性感染者的診斷手段，也有助於HBV感染者傳染性大小的判斷、HBV基因變異研究以及抗病毒藥物臨床療效的評價等。但是HBV DNA陽性及其定量檢測的拷貝數目多少並不與肝髒病理損害程度呈相關關係，故不能用HBV DNA的多少判定病情輕重程度。
（三）血清DNA多聚酶檢測
測定HBV特異的DNA聚合酶活性是反映HBV增殖的一個有用指標。HBV DNA聚合酶活性與HBsAg滴度及HBeAn陽性有關，一般說HBeAg陽性，Dane顆粒增殖多， DNA聚合酶活性也高。HBV DNA聚合酶常存在於Dane顆粒核心內，但30%-50%HBV感染者的血清內還有可溶性遊離 HBV DNA聚合酶存在。在肝炎早期即潛伏期即已出現，當轉氨酶升高時開始下降。若HBV DNA聚合酶繼續升高可能預示HBsAg攜帶者要變成慢性，並能預示活動性肝炎的發展。
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