各種細菌在代謝類型上表現了很大的差異。不同的細菌分解大分子碳水化合物、蛋白質和脂肪的能力不同，所能發酵的類型和最終產物也不一樣。不同細菌對營養的要求不同也說明了它們有不同的合成能力。所有這些都反映了它們是有不同的酶係統。
細菌的這種生化反應的多樣性在自然界產生了兩種結果：第一、使自然界所有的有機分子都有可能得到分解；第二、使不同細菌之間有了互相作用和互相依賴的基礎，例如，一種微生物能利用另一種微生物所分解的產物。
另一方麵，細菌的生化反應的多樣性也被人們作為細菌的鑒定和分類方法來利用。
本部分是通過細菌對大分子物質的水解試驗、糖發酵試驗、鑒定腸道菌的其他不同生化反應和微生物的代謝產物抗生素的測定等幾個實驗，來證明不同的細菌其生化功能的多樣性和微生物之間的互相作用。
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