小RNA病毒的不同屬和不同成員之間的區別,主要在於病毒RNA分子內核苷酸一級結構的不同。其結果,病毒蛋白內氨基酸殘基的排列順序不同,從而導致不同的抗原性及其在各種細胞內的不同的生長能力,其對pH的抵抗力和在氯化銫中的浮密度也不相同。小RNA病毒呈L434結構,病毒RNA指導合成一條完整蛋白,在特定酶的作用下,分解成L、P1、P2和P3產物。P1、P2和P3又進一步分別分解為4個(VP1~VP4)、3個(2A~2C)和4個(3A~3D)最終蛋白產物。P1又稱1ABCD,VP1~VP4相當於1D、1B、1C和1A。小RNA病毒衣殼構造的基本元件為蛋白亞單位,每個亞單位分別由1個VP1、VP2、VP3和VP4分子組成。VP1、VP2和VP3位於病毒粒子的表麵,VP4位於衣殼內側,緊貼於VP1、VP2、VP3複合體。亞單位以5 對稱軸首先形成五聚體,再由12個五聚體形成病毒衣殼。 圖16-1 小RNA病毒(鼻病毒)亞單位結構模式多數小RNA病毒的衣殼表麵粗糙不平,其凹凸差別可達25nm。在距5對稱軸約30nm附近,病毒表麵突然下凹,形成一個圍繞5對稱軸的大“渠溝”,稱為峽穀(Canyon),峽穀是受體結合部位,細胞受體ICAM1插入此穀,與穀底氨基酸發生接觸。峽穀下約05~10nm處有一空洞(Pocket),與峽穀相通。某些抗病毒化合物可以進入此洞,造成局部構型變化,使病毒峽穀底部完全失去同ICAM1受體結合的能力,病毒不能脫殼,從而抑製病毒複製。
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