VSV粒子分子量265.6±13.3103kDa,其中蛋白質占74%,類脂質占20%,糖類占3%,RNA占3%。VSV含有線狀負股單鏈RNA,從3’到5’端依次排列著N、NS、M、G和L5個不重疊的基因。在N基因3’端還有不翻譯的先導序列,在NNS、NSM、MG、GL基因之間有間隙子序列,在5’端有非翻譯區。VSVIndiana株RNA分子量為3.68106,全長11162核苷酸,無感染性。3’端的非翻譯先導序列長47個核苷酸(某些毒株48核苷酸),轉錄成為先導RNA,其功能不清。先導序列與N基因之間有AAA序列,VSVNewJesey株為AAAA,它可能與抑製宿主RNA合成有關。N基因有1333個核苷酸,編碼病毒的核蛋白;NS基因822個核苷酸,編碼磷酸蛋白;M基因838個核苷酸,編碼基質蛋白;G基因1672個核苷酸,編碼病毒糖蛋白;L基因6380個核苷酸,編碼病毒RNA聚合酶,在NNS、NSM、MG和GL之間的間隙子分別為GA、CA、GA、GA。5’端非編碼區有59個核苷酸。在病毒的正鏈轉錄物中,含有5個單順反子mRNA和一個47個核苷酸的非翻譯先導序列,有70個核苷酸未被轉錄,它們是5’末端的59個核苷酸、前導序列和N基因之間的AAA間隙子以及各結構基因之間的4個間隙子。核蛋白分子由422個氨基酸殘基組成,分子量為47355Da,每個病毒粒子中含有1258個拷貝,其作用是保護病毒RNA免受各種核酸酶的消化。磷酸蛋白分子由222個氨基酸殘基組成,VSVNewJersey株由274個殘基組成,和Indiana株核苷酸同源性隻有41%。每個病毒粒子中該蛋白質有466個拷貝,它和RNA聚合酶蛋白、核蛋白以及RNA共同維持病毒的轉錄活性。RNA聚合酶蛋白由2109個氨基酸組成,分子量241012Da,每個病毒粒子中有50個拷貝,是依賴於RNA的RNA聚合酶,直接決定著病毒RNA的轉錄活性。核蛋白、磷酸蛋白、RNA聚合酶蛋白和RNA複合物共同形成核糖核蛋白即核衣殼,它們對於RNA聚合酶活性的發揮都是必需的。糖蛋白在VSVIndiana株由511個氨基酸殘基組成,分子量57416Da,每個病毒粒子含有1205個拷貝,糖蛋白上有兩個糖基化位點,是病毒的主要表麵抗原,決定著病毒的感染力,也是病毒的保護性抗原。糖蛋白鑲嵌在病毒的脂質膜上,脂質膜的內側有基質蛋白,它由229個氨基酸組成,分子量26064Da,每個病毒粒子含有1826個拷貝,它作為一種連接蛋白,使核衣殼與嵌有糖蛋白的脂質膜接觸。其堿性較強,可通過與核衣殼結合抑製轉錄。水皰性口炎病毒對理化學因子的抵抗力與口蹄疫病毒相似。58℃30分鍾、可見光、紫外線及脂溶劑(乙醚、氯仿)都能使其滅活。病毒可在土壤中於4~6℃活存若幹天。對0.5%石炭酸能抵抗23天。0.05%結晶紫可以使其失去感染性。不耐酸。於感染細胞培養液中加入適量(2%)犢牛血清,可以明顯提高水皰性口炎病毒的穩定性。水皰性口炎病毒是高效的幹擾素誘生劑,可能是其能在增殖過程中生成雙股RNA,即dsRNA的緣故。
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