主管機構有責任通過實驗室主任來確保實驗室全體工作人員接受適當的健康監測。監測的目的是監控職業獲得性疾病。為達到這些目的，應進行如下工作：
1、根據需要提供主動或被動免疫
2、促進實驗室感染的早期檢測
3、應禁止高度易感人群（如孕婦或免疫損傷人員）在高危險實驗室中工作
4、提供有效的個體防護裝備和方法。
在一級生物安全水平操作微生物的實驗室工作人員的監測指南
曆史證據表明，在一級生物安全水平操作的微生物不太可能引起人類疾病或獸醫學意義的動物疾病。但理想的做法是，所有實驗室工作人員應進行上崗前的體檢，並記錄其病史。疾病和實驗室意外事故應迅速報告，所有工作人員都應意識到應用規範的實驗室操作技術的重要性。
在二級生物安全水平操作微生物的實驗室工作人員的監測指南
1、必須有錄用前或上崗前的體檢。記錄個人病史，並進行一次有目的的職業健康評估。
2、實驗室管理人員要保存工作人員的疾病和缺勤記錄。
3、育齡期婦女應知道某些微生物（如風疹病毒）的職業暴露對未出生孩子的危害。保護胎兒的正確措施因婦女可能接觸的微生物而異。
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