目前常用的三種體外 DNA 連接方法為:
① 用 T4或 E.coli DNA連接酶可連接具有互補粘性末端的 DNA片段;
② 用 T4 DNA連接酶連接具有平末端的 DNA 片段;
③ 先在 DNA 片段末端加上人工接頭,使其形成粘性末端,然後再行連接。
④ 將粘性末端補平或修平(用單鏈酶,如綠豆芽核酸酶)連接
柯斯質粒用於克隆大片段的 DNA分子特別有效,而這種特性對於研究高等生物的基因組十分重要。其特點:
1)具有 λ噬菌體的特性:在克隆了外源片段後可在體外被包裝成噬菌體顆粒,高效地感染對 λ噬菌體敏感的大腸杆菌細胞。進入寄主的柯斯質粒 DNA分子,按照 λ 噬菌體 DNA的方式環化, 但無法按噬菌體的方式生活,更無法形成子代噬菌體顆粒。
2)具有質粒載體的特性:在寄主細胞內如質粒一樣進行複製,攜帶有抗性基因和克隆位點,並具氯黴素擴增效應。
3)具有高容量的克隆能力:柯斯質粒本身一般隻有 5~7kb左右,而它克隆外源 DNA 片段的極限值竟高達 45kb,遠遠超過質粒載體及 λ 噬菌體載體的克隆能力。同時,由於包裝限製, 柯斯質 粒載體的克隆能力還存在一個最低極限值。 例如,5 kb大小的 柯斯質粒載體,插入的外源片段至少不能小於 30 kb。
M13是大腸杆菌絲狀噬菌體,其基因組為環狀 ssDNA, 大小為 6407bp。其生活史為:
1)通過性毛感染雄性(F+或 Hfr)大腸杆菌,或通過轉染進入雌性大腸杆菌細胞;
2)進入細胞後,轉變成複製型 (RF) dsDNA,然後以滾環方式製出 ssDNA。每當複製出單位長度正鏈,即被切出和環化,並被立即組裝成子代噬菌體和以出芽方式(即宿主細胞不被裂解)被釋放至胞外。
M13克隆載體是對野生型 M13進行改造後建成,其特點是雖然克隆外源 DNA的能力較小,一般隻適於克隆 300~400bp 的外源 DNA 片段,但特別適合用於製備克隆基因的單鏈 DNA。主要被用於製備測序用單鏈 DNA模板、特異的單鏈 DNA探針,進行定位誘變等,也可用於噬菌體展示。
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