歐洲藥典委員會1964年成立。1977年出版第一版《歐洲藥典》。從1980年到1996年期間，每年將增修訂的項目與新增品種出一本活頁本，匯集為第二版《歐洲藥典》各分冊，未經修訂的仍按照第一版執行。
1997年出版第三版《歐洲藥典》合訂本，並在隨後的每一年出版一部增補本，由於歐洲一體化及國際間藥品標準協調工作不斷發展，增修訂的內容顯著增多。
時隔五年，第四版《歐洲藥典》於2002年1月生效。最新版為第五版，即EP5.0，主冊EP5.0於2004年夏天出版；增補版EP5.1和EP5.2於2005年出版。
現已經出版到EP6.1
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