隨著現代醫學及相關科學技術的發展，各學科相互交叉和滲透，醫學微生物學檢驗技術已深入到細胞、分子和基因水平，許多新技術、新方法已在臨床微生物實驗室得到廣泛應用。醫學微生物學實驗室的基本任務之一是利用微生物學檢驗技術，準確、快速檢驗和鑒定臨床標本中的微生物，並對引起感染的微生物進行耐藥性監測，為臨床對感染性疾病診斷、治療、流行病學調查及研究等提供科學依據。
一、微生物形態學檢查基本技術
細菌形態學檢查是細菌檢驗的重要方法之一，它是細菌分類和鑒定的基礎，可根據其形態、結構和染色反應性等，為進一步鑒定提供參考依據。
(一)接種與分離方法
(二)細菌的培養方法
(三)細菌在培養基上生長特性
二、微生物培養與分離方法基本技術
大多數細菌均可以通過人工方法培養，而衣原體和病毒的分離培養往往需要活組織、雞胚、特殊細胞株及動物接種。隻有將微生物培養出來才能對它進行研究、鑒定和應用。
(一)顯微鏡檢查
(二)不染色標本檢查
(三)染色標本檢查
細菌標本經染色後，由於細菌與周圍環境間在顏色上形成鮮明對比，故在普通光學顯微鏡下可清楚地觀察到細菌的形態特征（如細菌的大小、形狀、排列等）和某些特殊結構（如莢膜、鞭毛、芽孢等），並可根據染色反應性對細菌加以分類鑒定。
常用染色法：革蘭氏染色法
