病毒基礎知識（5）

二、病毒分類和命名的規則
（一）一般規則
（1）病毒分類和命名應該是國際性的，並且普遍適用於所有的病毒。
（2）國際病毒分類係統采用目（order）、科(family)、亞科(subfamily)、屬(genus)、種(species)、分類階元。
（3）ICTV不負責病毒種以下的分類和命名，病毒種以下的血清型、基因型、毒力株、變異株和分離株的名稱由公認的國際專家小組確定。
（4）人工產生的病毒和實驗室構建的雜種病毒在病毒分類上不予考慮，它們的分類由公認的國際專家小組負責。
（5）分類階元隻有在病毒代表種的特性得到了充分了解和在公開出版物上進行過描述，以致於明確了它們的分類地位，並使其分類階元與其他類似的分類階元相區別時，才能確定下來。
（6）當病毒有明確的科、而分屬未確定時，這一病毒種在分類學上稱為該科的未確定種（unassigned species）。
（7）與規則2各分類階元相關聯，並得到ICTV批準的名稱是唯一可以接受的。
（二）分類階元的命名規則
（8）如果分類階元的建議名稱遵守ICTV公布的分類和命名規則，並且適合於已設立的分類階元，那麽這些建議名稱是有效名（valid names），在ICTV第六次報告中記錄已批準的國際名稱或經過ICTV表決批準的分類建議名稱是接受名(accepted names)。
（9）現有的病毒名稱和分類階元隻要是用的，就應該保留。
（10）病毒及其分類階元的命名不遵守優先法則（the rule of priority）。
（11）在設計新分類階元名稱時，不能使用人名進行命名。
（12）分類階元的名稱應該是易於使用和記憶，以諧音名（euphonious name）最好。
（13）上標、下標、連字符、斜線和希臘字母在設計新命名時不能使用。
（14）新名稱不應該與已批準的名稱重複，所選擇的新名稱也不應該與現在和過去使用的名稱相似或相近。
（15）縮拚字（sigla）若是由幾個研究小組建議，並且這一領域的病毒研究者是有意義的，那麽縮拚字可以接受作為分類階元的名稱。
（16）如果所建議的候選名（candidate name）不隻一個時，那麽相關下屬委員會應該首先向ICTV常務委員會作出推薦，然後由ICTV常務委員會決定哪一個候選名是可以接受的。
（17）當某一分類階元建議缺少適當的名稱時，這一分類階元仍然可以被批準，其待定名將保留至有一個建議名稱ICTV接受為止。
（18）由於所選用的病毒名稱完全或部分不隱含分類階元的任何意義，這樣就會出現下列不同的情形：① 一些病毒因名稱或缺少描述特征而從表麵上看是排斥在該分類階元中，但它們卻是這一已命名的分類階元成員；② 一些迄今尚未描述的病毒似乎是排斥在該分類階元中，但它們卻可能屬於這一已命名的分類階元；③一些病毒表麵上看來是屬於這一分類階元，但它們卻又是其他不同分類階元的成員。
（19）新分類階元名稱的選用應考慮國家或地區敏感性的問題，當一些名稱已被病毒學工作者在公開出版物上廣為使用時，該名稱或其派生名稱應該是命名的優先選擇，而不應該考慮這一名稱源自哪一個國家。
（20）名稱的改變、新名稱以及分類階元的設立和分類階元的排列的建議應該正式提交給ICTV常務委員會，在作出決定之前，ICTV下屬委員會和研究小組應該進行充分協商。
（三）種的規則
（21）病毒種是指構成一個複製譜係(replicating lineage)，占據一個特定小生境（ecological niche），具有多原則分類(polythetic class)特性的病毒。
（22）當ICTV下屬委員會不能肯定某一個新種的分類地位，或不能將這一新種確定在已設定的屬中時，新種會作為暫定種(tentative species)列在適當的屬或科中，按一般分類而言，暫定種的名稱不應該與已批準的名稱重複，選擇不相似或不相近於現在和不久前一直使用的名稱。
（23）種名由少數幾個有實際意義的詞組成，但不應該隻是由宿主名加“virus”構成。
（24）種名必須賦予種恰如其分的鑒別特征。
（25）數字、字母或其組合已經廣泛用作種的形容詞，然而新指定的編號、字母或其組合不再單獨作為種的形容詞。現存的數字或字母名稱仍可以繼續保留。
（四）屬的規則
（26）屬是一群具有某些共同特性的種。
（27）屬名的詞尾是“…virus”。
（28）一個承認的新屬必須有一個同時被承認代表種(type species)。
（五）亞科的規則
（29）亞科是一群具有某些共同特性的種。這一分類階元隻在需要解決複雜分類階元問題時使用。
（30）亞科名的詞尾是“…virinae”。
（六）科的規則
（31）科是一群具有某些共同特征的屬（無論這些屬是否構成亞科）。
（32）科名的詞尾是“…viride”。
（七）目的規則
（33）目是一群具有某些共同特征的科。
（34）目名的詞尾是“…virales”。
（八）亞病毒感染因子的規則
（35）有關病毒分類的規則也適用於類病毒（viroids）分類。
（36）類病毒種的詞尾是“viroid”，屬的詞尾為“-viroid”，亞科的詞尾是“-viroinae”（隻用於需要這一分類階元時），科的詞尾是“-viroidae”。
（37）逆轉座子（retrotransposons）在分類和命名中被考慮作為病毒。
（38）衛星和朊病毒不是按病毒分類，而是采用任意分類（arbitrary classification），並且這種任意分類對專門領域的研究工作者是有用的。
（九）書寫規則
（39）在正式使用場合，病毒目、科、亞科、屬的接受名（accepted name）一律用斜體打印，名稱的第一個字母要大寫。
（40）種名用斜體打印，第一個詞的首字母要大寫，除了是專有名詞（proper noun）外，其他詞首字母一律大寫。
（41）在正式使用場合，分類階元名稱應放在分類階元術語前。
如，各分類單元正式的描述是…Reovirideae(科)，…Phytoreovirus(屬), …wound tumor virus（種）等。

三、病毒分類原理及其依據
● 原理：強調其分類和命名的穩定性、實用性、認可性和靈活性。
穩定性是指病毒名稱及其隸屬關係一旦確定下來，就應該盡可能的保留。
實用性是指病毒分類體製應該對病毒學研究領域是有用的。
認可性是指病毒分類階元和名稱應該為病毒學研究者樂意接受和使用，所以，認可性也是實用性的必然結果。
靈活性是指病毒分類階元可以依據某些新發現而進行重新修訂和再確定。
● 依據：主要以病毒粒子特性、抗原性質和病毒生物學特性等作為依據。
病毒粒子特性：
① 病毒形態：如大小、形狀、包膜和包膜突起的有無，衣殼結構及其對稱性；
② 病毒生理生化和物理性質：如分子量，沉降係數，浮力密度，病毒粒子在不
同pH、溫度、Mg2+、Mn2+、變性劑、輻射中的穩定性；
③ 病毒基因組，如基因組大小、核酸類型、單雙鏈、線狀或環狀，正負鏈，G+C
所占的比例、核苷酸序列等；
④ 病毒蛋白，如結構蛋白和非結構蛋白的數量，大小以及功能和活性，氨基酸
序列等；
⑤ 病毒脂類含量和特性；
⑥ 碳水化合物含量和特性；
⑦ 病毒基因組組成和複製。
病毒抗原性質：
包括病毒血清學性質與其抗原的關係。
病毒生物學特性：
包括病毒天然的宿主範圍；
病毒在自然狀態下的傳播與媒介體的關係；
病毒的地理分布，致病機理，組織嗜親性；
病毒引起的病理和組織病理學特點。