細菌的接種方法有很多種，如劃線法、塗布法、傾注法、斜麵接種法、液體培養基接種法、螺旋接種法等，其方法和應用各有不同，下麵進行解釋以幫助實驗人員選擇操作。
劃線法：此法主要用於菌種分純，獲得單菌落
由接種環沾取少許待分離的材料，在無菌平板表麵進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線，微生物細胞數量將隨著劃線次數的增加而減少，並逐步分散開來，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養後，可在平板表麵得到單菌落。
優點：可以觀察菌落特征，對混合菌進行分離。
缺點：不能用於菌落計數。
塗布法：此法主要用於菌落總數計數
先將培養基熔化後趁熱倒入無菌平板中，然後用無菌吸管吸取0.1ml菌液接種在已凝固的瓊脂平板上。再用無菌L型玻璃棒將菌液在平板上塗抹均勻，將塗抹好的平板平放於桌上20~30min，使菌液滲透入培養基內，然後將平板倒轉，保溫培養，至長出菌落後即可計數。
優點：可以計數，可以觀察菌落特征。
缺點：接種前需梯度稀釋，吸收量較少，較麻煩，平板不幹燥效果不好，容易蔓延。
傾倒法：此法主要用於菌落總數的計數
吸取1ml菌液加入平板中，倒入已融化並冷卻至45~50℃的細菌培養基，輕輕轉動平板，使菌液與培養基混合均勻，冷疑後倒置，適溫培養。至長出菌落後即可計數。
優點：可以計數，較方便。
缺點：接種前需梯度稀釋，不能觀察菌落特征，不適用於嚴格好氧菌和熱敏感菌。
斜麵接種法：此法主要用於保存菌種，或觀察細菌的某些生化特性和動力
用接種環或接種針伸入菌種管內，挑取用來移種的菌落。伸入斜麵培養管內，先從斜麵底部到頂端拖一條接種線，再自下而上蜿蜒劃線，或直接自下而上地蜿蜒劃線。接種完成之後，用火焰滅菌培養管口，並塞上棉塞，置於37℃培養。
液體培養基接種法：此法主要用於菌液比濁實驗
用滅菌接種環挑取菌落或標本，在試管內壁與液麵交界處輕輕研磨，使細菌均勻得散落在液體培養基中。
螺旋接種法：此法主要用於菌落總數計數
Spiral plater可以在無任何全部或中間稀釋的情況下快速細菌接種。對數減少的樣品容量以阿基米德螺旋線的形式被自動分注在旋轉式培養基表麵。培養基上每一點的容量可以被知曉和校準。菌液的濃度可以通過培養皿上一定區域的菌落數量除以同區域樣品分注量來計算。
優點：螺旋接種法菌液無需稀釋（其他接種方法均需經過梯度稀釋才能計菌落數），自動化接種，效率高，可節省3/4的耗材和時間。
缺點：產品成本高，適用於樣品量比較大的實驗。
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