(一)常用的分子生物學技術
PCR技術在細菌的快速檢測、細菌的毒素基因檢測、細菌的耐藥性檢測及感染細菌的流行病學調查中得到日益廣泛的應用。
生物芯片是新近發展的一項對基因、蛋白質、細胞及其他生物組分進行大信息量分析的檢測技術。常用的有基因芯片(gene chips)和蛋白芯片(protein chips)。目前正在研製和評價中。
(二)鑒定感染細菌種屬的方法
1.細菌種屬的鑒定
此外限製性內切酶長度多態性分析(RFLP)、脈衝場凝膠電泳(PFGE)、隨機引物擴增法(RAPD)等技術常用於菌株間的差異比較。
2.細菌種屬特異基因
某些基因為細菌種特有或屬共有,通過對這些基因的檢測可以鑒定細菌的種或屬。如編碼吸附和侵襲上皮細胞表麵蛋白的inv基因:invA、invB、invC、invD、invE等是一組隻存在於致病性沙門菌中的獨特的保守基因序列。鞭毛蛋白dlh基因通常隻存在於傷寒沙門菌;IS6110、IS986插入片段為結核分枝杆菌複合群所擁有等。
3.細菌毒力基因
可以測定霍亂弧菌的霍亂毒素基因、產腸毒素大腸埃希菌的耐熱(ST)和不耐熱腸毒素(LT)以及白喉棒狀杆菌的外毒素基因以示相應的細菌存在。
(三)細菌耐藥性的分子生物學檢測
1.β內酰胺類抗生素的耐藥基因
青黴素結合蛋白(PBP)基因 耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌是由mec A基因介導的耐藥,肺炎鏈球菌對青黴素耐藥是由於PBP基因突變而致。
革蘭陰性菌產生的β內酰胺酶 由質粒介導的β內酰胺酶種類繁多,可以用PCR或基因探針的方法檢測和分類,如TEM、SHV、OXA、ROB型等。
2.糖肽類抗生素耐藥基因 腸球菌對糖肽類抗生素的耐藥基因由Van A、Van B、Van C等介導,測定這些基因可以預測對萬古黴素和壁黴素的耐藥性。
3.大環內酯類抗生素耐藥基因 紅黴素甲基酶erm基因、大環內酯類泵出基因mef A、mef E、msr A等基因參與了紅黴素的耐藥。
4.喹喏酮類抗生素耐藥基因 喹喏酮類抗生素的主要耐藥機製是由於螺旋酶和拓撲酶的突變,常與gyr和par基因突變有關。
5.分枝杆菌耐藥基因 對利福平的耐藥與rpoB變異有關,對異煙肼的耐藥與kat G和inh A有關。
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