三、關於包涵體的溶解:
1、 請教GST包涵體溶解
直接用8M的脲或 6M胍融解,取上清,測濃度。直接稀釋後包被檢測相應抗體。(由於快速稀釋相當於複性過程,產物用於檢測沒有問題的)
我所用的包涵體提取方法:
1.PBS或生理鹽水洗滌誘導後菌體,Buffer A重懸菌體,超聲波破碎至清亮
2.4度,10000rpm離心10分鍾,棄上清
3.用PBS或生理鹽水洗滌沉澱2-3次
4.往沉澱中加19.7ml Buffer A及0.3ml 20%的SKL(十二烷基肌氨酸鈉)貯存液,劇烈攪動,使其緩慢溶解,室溫靜置30分鍾至2小時
5.4度,10000rpm離心10分鍾,取上清
6.加20%PEG4000 210ul至終濃度為0.2%,加50mM的氧化型穀胱甘肽420ul至終濃度為1mM,加100mM的還原型穀胱甘肽420ul至終濃度為2mM,靜置30分鍾至2小時(亦可4度複性過夜)
7以PBS(pH8.0)或TE(pH8.0)透析,取出-20度保存備用
!Buffer A配方:
Tris-base 50mM
EDTA 0.5mM
NaCl 50mM
甘油 5%
DTT 5mM
2、包涵體的溶解
十二烷基肌氨酸鈉與十二烷基肌氨酸在溶解包涵體時,可不可以互相代替?可以替換,調pH不久沒什麽區別了嗎;兩者的功能團相同,pH不同,前者鈉鹽便於保存罷了
3、有關包涵體的溶解問題
強的變性劑如尿素(6-8M)、鹽酸胍(GdnHCl 6M),是通過離子間的相互作用,打斷包涵體蛋白質分子內和分子間的各種化學鍵,使多肽伸展,一般來講,鹽酸胍優於尿素,因為鹽酸胍是較尿素強的變性劑,它能使尿素不能溶解的包涵體溶解,而且尿素分解的異氰酸鹽能導致多肽鏈的自由氨基甲酰化,特別是在堿性pH值下長期保溫時。SDS、正十六烷基三甲基銨氯化物、Sarkosyl等是去垢劑,可以破壞蛋白內的疏水鍵,也可溶解一些包涵體蛋白質。另外,對於含有半胱氨酸的蛋白質,分離的包涵體中通常含有一些鏈間形成的二硫鍵和鏈內的非活性二硫鍵。還需加入還原劑,如巰基乙醇、二硫基蘇糖醇(DTT)、二硫赤蘚糖醇、半胱氨酸。對於目標蛋白沒有二硫鍵某些包涵體的增溶,有時還原劑的使用也是必要的,可能由於含二硫鍵的雜蛋白影響了包涵體的溶解。
4、8M尿素溶解的包涵體溶液應如何保存?
我在4度放了半個月,目前沒出什麽問題
5、8M尿素溶解的包涵體溶液在室溫下可以放多久而不出現問題?
BI溶液在室溫放置48小時,可能會對目的蛋白有影響,因為尿素在堿性條件下可使一些氨基酸酰基化,因而早些處理BI溶液比較好。具體有什麽影響我也不是很清楚。
6、GST融合蛋白形成包含體不溶,咋辦?
GST融合蛋白應該不能用尿素等作用太強的變性劑,否則GST融合蛋白是不能與beads相結合的
GST的Beads是應用酶與底物結合的原理,所以要去除處理因素後才好結合,不知你的溫和的去汙劑是什麽?
做完裂解之後加Triton X-100輕搖30min,蛋白溶解的會多些!
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