一、堿變性法提取質粒DNA
質粒(Plasmid)是細菌染色體外能自身獨立複製的雙股環狀DNA。帶有遺傳信息，可賦予細菌某些新的表型。將質粒指紋圖譜分析方法、質粒 DNA探針技術及檢測質粒的PCR技術用於臨床感染性疾病的診斷和流行病學調查已成為現實。質粒作為載體在基因工程中起著重要的作用。
分離和純化質粒DNA的方法很多,但這些方法基本包括三個步驟：即細菌的培養和質粒DNA的擴增；細菌菌體的裂解;質粒DNA的提取與純化。
本實驗學習用堿變性方法提取質粒DNA 。
【原理】
細菌培養物加入SDS和NaOH堿性溶液處理後，菌體裂解，可使細菌的質粒DNA、染色體DNA和RNA一起從細胞內釋放出來，經瓊脂糖凝膠電泳，因各種核酸分子的遷移率不同將上述核酸分成不同的帶。用溴化乙錠（EB）染色後，在紫外線燈下可看到各種核酸帶發出的熒光。根據熒光的位置，可區分不同的核酸帶。
【材料】
1、菌株E.coliJM109（pUC19），E.coliRRI（pBR322）
2、試劑溶液Ⅰ(50mM葡萄糖,25mMTris.HclPH8.0,10mMEDTA)
溶液II(0.2NNaOH，1%SDS)用前新配製
溶液III(5mMKAc溶液，PH4.8)
TE緩衝液(10mMTris.Hcl,1mMEDTA，PH8.0)
LB液體培養基(胰蛋白腖10g，酵母粉5g,Nacl10g，加蒸餾水溶解，用NaOH調PH至7.5，加水至1000ml，15磅高壓滅菌15分鍾。)
【方法】
1、接種細菌於5mlLB液體培養基中，37℃培養過夜。
2、3000rpm/min,離心15min，棄上清。加入100ul溶液Ⅰ懸起細菌沉澱。
3、加入200ul前新配製的溶液II，顛倒EP管5次混合均勻，置冰浴2min。
4、加入150ul溶液III溫和地混勻，12000rpm/min,離心5min。
5、吸取上清清亮裂解液放入另一新EP管中，加等體積酚-氯仿-異戊醇抽提2次，12000rpm/min,離心2min。（若不做酶切，此步可省略）吸取上清放入另一新EP管中，加入二倍體積的冷乙醇，12000rpm/min,離心10min。
6、棄乙醇，幹燥後用30ulTE緩衝液洗下核酸，待電泳檢測。
