二、瓊脂糖凝膠電泳
瓊脂糖凝膠電泳技術（Agarosegelelectroghoresis）是分離、鑒定和提純DNA片斷的有效方法。凝膠分辨率決定於使用材料的濃度，並由此決定凝膠的孔徑。瓊脂糖凝膠可分辯0.1~6.0kb的雙鏈DNA片段。瓊脂糖凝膠電泳是一個電場作用。它首先利用瓊脂糖的分子篩效應，此外，在弱堿性條件下，DNA分子帶負電荷，從負極向正極移動。根據DNA分子大小、結構及所帶電荷的不同，它們以不同的速率通過介質運動而相互分離。借助溴化乙錠（EB）能與雙鏈DNA結合的作用，利用EB染色，並通過紫外線激發即可觀察被分離DNA片段的位置。
【材料】
1、瓊脂糖、10×TAE電泳緩衝液（40mMTris,20mMNaAc,1mMEDTA，PH8.0）
2、載體緩衝液（0.25%溴酚藍，30%甘油）、溴化乙錠水溶液（10mg/ml）
3、凝膠槽、電泳儀
【方法】
1、取瓊脂糖0.9g，加入100ml1xTAE電泳緩衝液於250ml燒瓶中，100℃加熱溶解。
2、平衡凝膠槽，放好兩側擋板，調節好梳子與底板的距離（一般高出底板0.5~1mm）。
3、鋪板：在溶解好的凝膠中加入終濃度為0.5ug/ml的溴化乙錠水溶液，輕輕混勻，待冷至500C左右倒入凝膠槽，膠厚一般為5~8mm。
4、待膠徹底凝固後，去掉兩側擋板，將凝膠放入盛有電泳液的槽中（加樣孔朝向負極端，DNA由負極向正極移動），使液麵高出凝膠2~3mm，小心拔出梳子。
5、DNA樣品與載體緩衝液5：1混合並加入凹孔中（樣品不可溢出）。
6、打開電源，調節所需電壓，電壓與凝膠的長度有關，一般使用電壓不超過5v/cm。
7、據指示染料移動的位置，確定電泳是否終止（溴酚藍的湧動距離在5sRNA和0.3kbDNA帶之間）。
8、電泳完畢關閉電源。將凝膠放紫外燈下觀察並拍照。
