四、針對汙染源常使用的防治方法
A. 種類
1. 熱療－對病毒較有效但須花費時間。處理時，需6-12星期在30-40℃。
2. 冷療法－亦對病毒有效。
3. 利用抗生素。
4. 以分生組織，不帶病毒等汙染源。
5. 利用培養基中高糖，高鹽的濃度。
6. 利用抗並毒藥物。
7. 營養需求不同。
8. 利用水。
9. 抽樣檢測。
B. 防治方法之效果討論
1. 熱療法及冷療法
對病毒有效，但須花時間處理，例如：熱療法處理時間需花6-12星期在30-40℃。
2. 利用抗生素
這是目前較常用的方法，但是在抗生素加入培養基，其有效濃度常因植物具有半滲透功能，而使濃度無法達到有效濃度。使用抗生素時，需注意下列事項：
（1）要知道抑製的微生物為何，再使用抗生素，及對症下藥。
（2）要決定最小抑製濃度，以降低成本。
（3）要確定抗生素不會對植物造成並害或突變。
（4）確定抗生素在培養基上是否有作用。
（5）使用時，常因需要而多種混合或交替使用。
（6）有些抗生素在某些國家是禁止使用，使用前必須做詢問此藥劑是否合法使用。
使用抗生素的缺點
（1）可能對哺乳類動物有害。
（2）若是使用生長期較長的植物，微生物亦有抗藥性產生。
（3）容易錯誤使用：沒有針對微生物而使用各種不同的抗生素。
抗生素的種類 對象
抑製細胞壁合成
Bactracin G(+)，殺菌，對抗β-lactams的菌有作用
β-lactams G(+)，殺菌，若用10-100倍，則對G(-)有效
Glycopeptides G(+)，殺菌，但恨貴，不易有抗藥性
抑製膜的形成
plymixins 對G(-)Psedomonas spp.有效
抑製蛋白質的合成
Ghloramphrnical 殺菌作用，便宜，但對植物有毒害作用
Aminoglycosides 使用對象廣泛，對植物有毒害作用，在堿性環境下較有活性可針對G(-)可和盤尼西林(pencillins)一起作用
Macrolides and 對G(+)有靜菌作用
Lincosamides
Tetracyclines 為靜菌作用，對G(+)、G(-)都可以會刺激酵母菌，植物有害對
核酸抑製物質
Qutnolnes 殺菌，對 G(+)有效，10-100倍濃度則對G(-)有效，有抗藥性產生，可引起過敏反應易
Rifampicin 殺菌，對一些G(+)或G(-)的細菌有作用，但常有抗藥性產生
Trimethoprim 對於一些 G(+)或G(-)的細菌有作用，Trimethoprim
Sulphonamides Sulphonamides兩種混合使用有加強的作用
Sulphonamides在堿性環境下較活躍
3. 分生組織法
主要是針對在植物內部寄主的菌類，如病毒等。因其生長速度無法長到頂芽的分生組織，所以在頂芽的分生組織則無病原菌存在。可以利用此分生組織培養成植株即可避免感染問題。
4. 利用培養基中高鹽或高糖的濃度
在培養基中有一些高鹽或高糖的濃度可抑製微生物生長，或有單寧酸的存在時也可以達到抑製效果。
5. 利用抗病毒藥物
Ribaririn－對於ssRNA病菌有抑製作用，但是價格昂貴。
6. 營養需求不同
因為不同的菌類其營養需求不同，因此可利用選擇性培養基可篩選或抑製一些微生物。
7. 利用水淹
利用水將植株清洗或是完全浸沒，以避免其上的接種源四處擴散。
8. 抽樣檢測
對於後代植株的抽樣檢測，可將汙染嚴重的個體去除。以上這些方法可以綜合使用，以建立一個清潔的植株。
五、汙染所造成的結果
1. 生產成本的提高。
2. 對植株造成傷害。
3. 增加接種源及汙染的機率。
六、在組織培養過程各個階段所應注意事項
（1）目前組織培養之流程主要分兩種，如下圖所示：
在此兩種係統中，ModelⅠ和ModelⅡ之比較：
ModelⅠ：先做好一小批產品，再進入量產，此每一單位為一瓶，且自為獨立環境，具區隔性，故有汙染時所造成的傷害不大。
ModelⅡ：其為大容器係統，一旦有汙染，則整批無法避免將會受到汙染其培養基多為液體狀態。
（2） 各階段注意事項
stage0： 建立幹淨的植株，以利下麵階段的作業進行。隻要建立無菌的植株，則汙染的來源便隻是來自技術上的失誤。因此在此階段要將病株丟除，並且將其具較多汙染源的植株去掉。一般會選擇較成熟的植株，因其病征易顯現找到植株後。分離其菌或病原菌，做係列稀釋以決定濃度。
stageⅠ：在stageⅠ的汙染可蔓延培養基，故可利用“視覺”將之選出或丟棄，對於潛伏性或是表現微弱的菌種，需作特別的測試，在此階段，要對一般的微生物作測試及對已知的病原菌作測試，若兩種為負便可進入stageⅡ。stageⅡ要把汙染的植株去掉，知道病原菌並重複分生組織的培養。
stageⅡ：在此階段中，隻有無菌的植株可繁殖。假設此植株為無菌，則汙染源便來自操作室，故要先丟掉汙染後，然後再取樣抽檢。
stageⅢ：如同stageⅡ。
stageⅣ：對後代植株需取樣檢查。
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