多數植物病毒具有一種以上的傳播途徑，因此，在研究某種病毒時往往發生其它病毒的汙染。這直接影響實驗結果，必須采取嚴格的措施加以防止。
一．手和用具消毒
有些病毒有較高的體外穩定性，可以通過手、研缽或其它器具侵染供試植物。最易發生汙染的病毒是煙草花葉病毒(TMV)和馬鈴薯X(PVX) 。可以采取下述措施。
1．用具消毒將研缽、吸管等耐高溫器皿在180℃處理1小時，或沸水煮15-20分鍾。
2．試驗前後用肥皂洗手2-3次,最好用磷酸鈉肥皂洗，其配方如下:
磷酸三鈉 5克，肥皂 20克，水 100ml
用水將肥皂融化後，加入磷酸三鈉，混勻晾幹即可使用。
3．小心操作在溫室內不要直接用手去接觸植物，澆水、移苗等操作要盡可能輕，避免造成人為傳播。
二．防蟲注意門窗縫隙、尼龍紗是否有破損;溫室周圍無雜草;定時噴灑殺蟲藥劑。
三．土壤消毒一般121℃高壓蒸汽滅菌一小時以上。
四．使用無毒試驗材料特別是種子、繁殖用苗木。
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