真菌是一項豐富的自然資源。人和動物每年消耗大量的真菌菌體和子實體；真菌也是重要的藥材。真菌的某些代謝產物在工業上具有廣泛用途，如乙醇，檸檬酸，甘油，酶製劑，甾醇，脂肪，塑料，促生素，維生素等。而且這些東西都能進行大規模的生產。在真菌的腐解作用中，它使許多重要化學元素得以再循環。真菌直接或間接地影響著地球生物圈的物質循環和能量轉換。
真菌有以下幾種：
1、黴菌：亦稱“絲狀菌”。屬真菌。體呈絲狀，叢生，可產生多種形式的孢子。多腐生。種類很多，常見的有根黴、毛黴、曲黴和青黴等。黴菌可用以生產工業原料(檸檬酸、甲烯琥珀酸等)，進行食品加工(釀造醬油等)，製造抗菌素(如青黴素、灰黃黴素)和生產農藥(如“920”、白僵菌)等。但也能引起工業原料和產品以及農林產品發黴變質。另有一小部分黴菌可引起人與動植物的病害，如頭癬、腳癬及番薯腐爛病等。
2、酵母菌：體呈圓形、卵形或橢圓形，內有細胞核、液泡和顆粒體物質。通常以出芽繁殖；有的能進行二等分分裂；有的種類能產生子囊孢子。廣泛分布於自然界，尤其在葡萄及其他各種果品和蔬菜上更多。是重要的發酵素，能分解碳水化合物產生酒精和二氧化碳等。生產上常用的有麵包酵母、飼料酵母、酒精酵母和葡萄酒酵母等。有些能合成纖維素供醫藥使用，也有用於石油發酵的。
3、啤酒酵母（Saccharomyces）：細胞呈圓形、卵形或橢圓形。以出芽繁殖，能形成子囊孢子。在發酵工業上，可用來發酵生產酒精或藥用酵母，也可通過菌體的綜合利用提取凝血質、麥角固醇、卵磷脂、輔酶甲與細胞色素丙等產品。
4、紅曲黴素（Monascuspurpureus）屬於囊菌綱，曲黴科。菌絲體紫紅色。無性生殖時，茵絲分枝頂端形成單獨的或一小串球形或梨形的分生抱子。有性生殖時，產生球形、橙紅色的閉囊果，內生含有八個子囊孢子的子囊。紅曲黴可製紅曲、釀製紅乳腐和生產糖化酶等。
5、假絲酵母（Candida）：屬於能形成假菌絲、不產生子囊孢子的酵母。不少的假絲酵母能利用正烷烴為碳源進行石油發酵脫蠟，並產生有價值的產品。其中氧化正烷烴能力較強的假絲酵母多是解脂假絲酵母（C.lipolytica）或熱帶假絲酵母（C.tropicalis）。有些種類可用作飼料酵母；個別種類能引起人或動物的疾病。
6、白色念珠菌（Candidaalbicans）亦稱“白色假絲酵母”。一種呈橢圓形、行出芽繁殖的假絲酵母。通常存在於正常人的口腔、腸道、上呼吸道等處，能引起鵝口瘡等口腔疾病或其他疾病。
7、黃曲黴（Aspergillusflavus）：半知菌類，黃曲黴群的一種常見腐生真菌。菌落生長較快，結構疏鬆，表麵黃綠色，背麵無色或略呈褐色。菌體由許多複雜的分枝菌絲構成。營養菌絲具有分隔；氣生菌絲的一部分形成長而粗糙的分生孢子梗，梗的頂端產生燒瓶形或近球形的頂囊，囊的表麵產生許多小梗(一般為雙層)，小梗上著生成串的表麵粗糙的球形分生孢子。分生孢子梗、頂囊、小梗和分生孢於合成孢子穗。可用於生產澱粉酶、蛋白酶和磷酸二酯酶等，也是釀造工業中的常見菌種。近年來，發現其中某些菌株會產生引起人、畜肝髒致癌的黃曲黴毒素。
8、白地黴（Geotrichumcandidum）：菌落平麵擴散，組織輕軟，乳白色。菌絲生長到一定階段時，斷裂成圓柱狀的裂生抱子。菌體生長最適宜的溫度為28℃。常見於牛奶和各種乳製品(如酸牛奶和乳酪)中；在泡菜和醬上，也常有白地黴。可用來製造核苦酸、酵母片等。
9、抗生菌，亦稱“拮(頡)抗菌”。能抑製別種微生物的生長發育，甚至殺死別種微生物的一些微生物。其中有的能產生抗菌素，主要是放線菌及若幹真菌和細菌等。如鏈黴菌產生鏈黴素，青黴菌產生青黴素，多粘芽抱杆菌產生多粘菌素等。
10、假菌絲：某些酵母如假絲酵母經出芽繁殖後，子細胞結成長鏈，並有分枝，稱為假菌絲。細胞間連接處較為狹窄，如藕節狀，一般沒有隔膜。
11、抗菌素：亦稱“抗生素”。主要指微生物所產生的能抑製或殺死其他微生物的化學物質，如青黴素、鏈黴素、金黴素、春雷黴累、慶大黴素等。從某些高等植物和動物組織中也可提得抗菌素。有些抗菌素，如氯黴素和環絲氨酸，目前主要用化學合成方法進行生產。改變抗菌素的化學結構，可以獲得性能較好的新抗菌素，如半合成的新型青黴素。在醫學上，廣泛地應用抗菌素以治療許多微生物感染性疾病和某些癌症等。
12、病原性真菌：對人類致病的真菌分淺部真菌和深部真菌，前者侵犯皮膚、毛發、指甲，為慢性，對治療有頑固性，但影響身體較小，後者可侵犯全身內髒，嚴重的可引起死亡。此外有些真菌寄生於糧食、飼料、食品中，能產生毒素引起中毒性真菌病。
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