（1）糞便：一般將糞便或肛拭直接接種於SS和麥康凱平板上，用兩種培養基的目的是為提高標本的陽性檢出率。
（2）血液和骨髓：抽取患者血液5ml或骨髓0.5ml，立即接種於含0.5%膽鹽肉湯或葡萄糖肉湯5ml試管中進行增菌，48h將培養物移種到血平板和腸道鑒別培養基上，若有細菌生長取菌塗片革蘭染色並報告結果。對增菌培養物連續培養7天，仍無細菌生長時，則報告陰性。
（3）尿液：取尿液2～3ml經硫磺酸鹽肉湯增菌後，再接種於腸道菌選擇培養基或血平板上進行分離培養，亦可將尿液離心沉澱物分離培養。
（4）局部感染的膿液。
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