盡可能在發病早期及治療前采集新鮮糞便，選擇膿血便或粘液便，必要時可用肛拭子采集。
2.檢驗方法及鑒定
（1）分離培養：取糞便（粘液或膿血部分）或肛拭標本接種GN肉湯增菌及再進行分離培養。一般同時接種強弱選擇性不同的兩個平板。強選擇鑒別培養基可用沙門、誌賀菌選擇培養基（SS）；弱選擇培養基可用麥康凱或中國藍培養基。培養18～24h後選取可疑菌落進行下列鑒定。
（2）鑒定
1）初步鑒定：挑選可疑菌落3～4個先用誌賀菌屬多價診斷血清作試探性玻片凝集試驗。將試探性凝集試驗陽性的菌落至少接種2～3支KIA和MIU，經35 ℃培養18～24h，凡符合KIA：K／A、產氣-／+、H2S-，MIU：動力-、吲哚+／-、尿酶-，並結合試探性玻片凝集試驗陽性結果可鑒定為誌賀菌屬。
2）最後鑒定
3.與類誌賀鄰單胞菌和傷寒沙門菌的鑒別：可用動力和氧化酶試驗加以鑒別，誌賀菌均為陰性，而類誌賀鄰單胞菌為陽性。傷寒沙門菌硫化氫和動力陽性，能與沙門菌屬因子血清（0多價A-F群或Vi）凝集而不與誌賀菌屬因子血清凝集。
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