1.腸道外感染：主要由正常菌群條件致病，以泌尿係統感染常見，高位嚴重尿道感染與特殊血清型大腸埃希菌有關。如菌血症、膽囊炎、腹腔內膿腫。
2.腸道感染：致病性大腸埃希菌有下列五個病原群。
（1）腸產毒型大腸埃希菌（ETEC）：引起霍亂樣腸毒素腹瀉（水樣瀉）。
（2）腸致病型大腸埃希菌（EPEC）：主要引起嬰兒腹瀉。
（3）腸侵襲型大腸埃希菌（EIEC）：可侵入結腸黏膜上皮，引起誌賀樣腹瀉（能產生粘液膿血便）。
（4）腸出血型大腸埃希菌（EHEC）：又稱產誌賀樣毒素（VT）大腸埃希菌（SLTEC或UTEC），其中O157:H7可引起出血性大腸炎和溶血性尿毒綜合征（HUS）。臨床特征為嚴重的腹痛、痙攣，反複出血性腹瀉，伴發熱、嘔吐等。嚴重者可發展為急性腎衰竭。
（5）腸粘附（集聚）型大腸埃希菌（EAggEC）：也是新近報道的一種能引起腹瀉的大腸埃希菌。
3.CDC將大腸埃希氏菌O157:H7列為常規檢測項目
EHEC的血清型>50種，最具代表性的是O157:H7.在北美許多地區，O157:H7占腸道分離病原菌的第二或第三位，是從血便中分離到的最常見的病原菌，分離率占血便的40%，6、7、8三個月O157:H7感染的發生率最高。且0157是4歲以下兒童急性腎功衰的主要病原菌，所以CDC提出應將大腸埃希氏菌0157:H7列為常規檢測項目。
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