一、生物學性狀
HCV大小為30～60mm，有包膜。HCV基因組為一單正鏈RNA，長度約9.5kb，由9個基因區組成，自5′端開始，依次為5′端非編碼區，核心衣殼白區（C區），包膜蛋白-1區（E1），包膜蛋白-2區/非結構蛋白-1區（E2/NS1），NS2區，NS3區，NS4區，NS5區和3′端非編碼區。5′端非編碼區核苷酸保守性強，在各株病毒間很少變異，可用於診斷。其中E1，E2/NS1區易發生變異，致包膜蛋白的抗原性變異而不被原有的抗包膜抗體所識別，病毒得以持續存在。這可能是HCV引起的丙型肝炎易發展為慢性肝炎的原因之一。
根據世界各地分離的HCV毒株，可將HCV分為6種基因型，我國以Ⅱ型為主。目前為Ⅱ型HCV複製產生的病毒量多，較難治療。
NS3，NS4及NS5區基因可分別表達蛋白質，其中NS4表達的蛋白（C100-3）和NS3表達的C33c可作為抗原用於檢測患者血清。
二、致病性和免疫性
經輸血、血製品或汙染注射器而傳播，是引起輸血後慢性肝炎和肝硬化的主要原因之一。大多數丙型肝炎患者不出現症狀，發病時已成慢性過程。慢性肝炎的表現亦輕重不一，約20%可發展為肝硬化。並可導致肝癌，我國肝癌患者中約10%有抗-HCV抗體。
丙型肝炎患者恢複後，僅有低度免疫力，且免疫力不牢固。感染HCV後，機體可依次出現抗-C33c，抗-C及抗-C100-3，可用於診斷還可用套式RT-PCR檢測HCVRNA.
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