原生動物是原生動物亞界的物種統稱，包括一大群單細胞的真核(擁有明確的細胞核)生物。原生動物是最簡單的生物之一。雖然構成一個亞界，但它們相互之間並不一定有親緣關係。從生物學的觀點來看，這些它們並非屬於一個自然的類群，而隻是將一大批生物體集合起來而已。已經記述的原生動物計有65,000多種，其中一半以上為化石。
原生動物無所不在，從南極到北極的大部分土壤和水生棲地中都可發現其蹤影。大部分肉眼看不到。許多種類與其他生物體共生，現存的原生動物中約1/3為寄生物。因為現代的電子顯微鏡技術和新的生化和遺傳學技術提供了越來越多的知識，有助於人們認識各種原生生物物種和類群之間的關係，也因而常常證明以前的分類是不正確的，並使原生動物的分類需要經常修正。
在原生動物門裏，根據運動胞器、細胞核以及營養方式可以分成4個綱：（1）鞭毛蟲綱。運動胞器是一根或多根鞭毛，例如綠眼蟲、衣滴蟲。（2）肉足蟲綱。運動胞器是偽足，偽足兼有攝食功能，例如大變形蟲。（3）孢子蟲綱。沒有運動胞器，全部營寄生生活，例如間日瘧原蟲。（4）纖毛蟲綱。運動胞器是纖毛，有兩種細胞核，即大核和小核，大核與營養有關，小核與生殖有關，例如尾草履蟲。
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