1）螺旋對稱殼體。蛋白質亞基沿中心軸呈螺旋狀排列，形成高度有序、對稱的穩定結構。
螺旋對稱的殼體形成直杆狀、彎曲杆狀和線狀等杆狀病毒顆粒。很多植物病毒如TMV等則為堅硬的杆狀，而某些植物病毒和細菌病毒的形狀是軟而能彎曲的很長的纖維狀。昆蟲病毒中核型多角體病毒屬成員也多呈杆狀。
2）二十麵對稱殼體。蛋白質亞基圍繞具立方對稱的正多麵體的角或邊排列，進而形成一個封閉的蛋白質的鞘。因二十麵體容積為最大，能包裝更多的病毒核酸，所以病毒殼體多取二十麵體對稱結構。
病毒的殼體為二十麵體對稱，大部分動物病毒和少數植物病毒呈球狀病毒顆粒。各種病毒的衣殼亞基數目不一，排列方式不同，亞基往往聚在一起形成2、3、4、5或6鄰體，因而使電鏡下的近球狀病毒的外形變化多端。此外，有些動物病毒如腺病毒每個二十麵體的頂點處都有一纖維狀的細絲，很像一個衛星天線，使它們的外形更為別致。近年來，又發現一類新型病毒即雙生病毒。它的結構特點是2個二十麵體聯在一起，而每個球體由12個蛋白亞基構成，兩兩聯結時粘合處失去一個亞基。
3）複合對稱殼體。僅少數病毒殼體為複合對稱結構。殼體由頭部和尾部組成，包裝有病毒核酸的頭部通常呈二十麵體對稱，尾部呈螺旋對稱。具有複合對稱結構的典型例子是有尾噬菌體（tailed phage）。
有複合對稱殼體的細菌病毒（噬菌體）和某些動物病毒呈複雜形狀的病毒顆粒。
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