病毒如此細小，絕大多數病毒必須借助電子顯微鏡才能觀察，電子顯微鏡的分辨率是光學顯微鏡的1000倍。
裝配成熟的病毒顆粒大小恒定不再改變，測量病毒大小的單位是納米，主要方法是在電子顯微鏡下直接測定，也可利用過濾的方法測定病毒粒子的大小。
不同病毒間大小差異很大。最小的如植物的聯體病毒（Geminiviruses）直徑僅18～20nm，最大的動物痘病毒（Poxviruses）大小達300～450nm×170～260nm，最長的如絲狀病毒科（Filoviridae）病毒粒子大小為80nm×790～14000nm.
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