是指用基因工程的方法表達出病原物的一段基因序列，將表達產物（多數無毒性、無感染能力、但具有較強的免疫原性）用作疫苗。
1.亞基疫苗（subunit vaccine）
利用病原物的某一部分製得的疫苗。
優點：1）避免了直接使用病原物可能致病的危險；
2）利用純化蛋白質作為免疫源，避免了外源蛋白、核酸混雜而造成的種種副作用，使疫苗更安全；
3）有時單獨使用特異蛋白能增強疫苗的效果。
局限性：1）表達可能很低；
2）蛋白質構象折疊可能不正確；
3）免疫力弱且持續時間短。
2肽疫苗(peptide vaccine)
將隻與抗原決定簇相對應的小肽連接在大分子載體蛋白上，製成的疫苗稱為肽疫苗。
優點：1）最突出的是可以用化學合成的方法合成肽，省去了以重組DNA為基礎的亞單位疫苗產品的純化步驟；
2）肽疫苗隻用抗原蛋白的一部分，不會產生該蛋白其他部分引起的不必要的免疫反應。
實例：口蹄疫疫苗
傳統的口蹄疫疫苗是一種滅活病毒疫苗：1）需冷凍狀態保存；2）具有危險性；3）生產花費巨。
4DNA免疫
DNA免疫又稱基因免疫（genetic immunity）或核酸免疫。
1993年，Wolff等人意外地發現，將DNA直接注射小鼠骨骼肌細胞後可引起特異性的免疫反應，並可持續2個月以上。
DNA免疫的優越性：
1）DNA比蛋白質更穩定，保存的時間較長；
2）DNA的提取和純化比蛋白質容易得多；
3）任何DNA片段都可以插入質粒中製成疫苗；
4）對目前難以用常規疫苗防治的疾病的預防和治療有重要意義。
但DNA疫苗普遍存在免疫效率較低的問題。
5艾滋病（AIDS）疫苗
5．1AIDS的定義
獲得性免疫缺陷綜合症（AIDS）：即HIV檢測陽性的個體。
1） 全血的CD4T細胞數小於200個/mm3（正常值600~1000個/mm3），或CD4T細胞占整個淋巴細胞數不到14%；
2） CD4T細胞數等於或大於200個/mm3，但伴有最常見的與AIDS相關的機會性感染，包括：
細菌病：肺結核和其它分枝杆菌屬感染，或複發性沙門氏菌敗血症。
真菌病：假絲酵母病、球孢子菌病、隱球酵母病、肺囊蟲屬肺炎等。
病毒性疾病：巨細胞病毒感染、與HIV相關的腦病、單純皰疹病毒引起的慢性潰瘍和支氣管炎等。
惡性腫瘤：Kaposi肉瘤、溫襲性子宮頸癌、腦原始淋巴瘤等。
5．2人類免疫缺陷病毒（HIV）
5．3HIV病毒的致病機理及患者的感染進程
HIV病毒一旦進入細胞，就可在細胞內大量繁殖，從而導致感染細胞的破裂，這稱為直接殺傷。最易受到HIV病毒侵染的細胞是輔助T細胞，即CD4T淋巴細胞，它是免疫係統的支柱細胞之一，因而HIV病毒感染後的主要症狀是免疫能力低下，CD4T淋巴細胞數量急劇降低。
5．4HIV的生活史及治療藥物
1）逆轉錄酶抑製劑
抑製逆轉錄酶，從而阻止基因整合。包括應用最廣的第一代抗HIV藥物AZT（疊氮胸苷）。
2）HIV蛋白水解酶抑製劑
阻斷HIV蛋白質活性，防止其進行剪切產生新的HIV蛋白質。有可能成為第二代有效的HIV化療藥物。
3）混合療法
解決耐藥性問題，采用多種藥物聯合作用的辦法。（1996，美國何大一博士首創雞尾酒療法（cocktail therapy），被評為當年“時代周刊”風雲人物）混合療法是目前化學治療的首選方法。
5.5HIV基因的多樣性阻礙了AIDS疫苗的研究進展。目前，AIDS疫苗的研製包括
1）亞基疫苗：將編碼多種HIV外膜蛋白的基因，用基因工程的方法合成病毒疫苗。亞基疫苗的臨床實驗目前仍在進行。
2）滅活的完整HIV作為疫苗：隻限於感染HIV的患者使用。
3）活的減毒疫苗：被HIV-1（一種相關病毒，隻引起溫和的AIDS）感染的個體可以保護不被HIV-2（引起嚴重AIDS）感染。
4）其他：HIVgp160疫苗、CD4受體疫苗等。
6結束語
到目前為止，還沒有獲得有效的AIDS疫苗。而且，AIDS疫苗在治療患者時，並不十分有用，因為他們的免疫係統已衰弱，不能對疫苗產生反應！
盡管我們對HIV分子水平的了解和對AIDS的臨床研究已取得了相當的進展，但對抗AIDS的主要手段，目前仍是以加強社會教育和避免危險的行為為主。
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