CO2固定
自養菌固定CO2的三條途徑
1. Calvin循環：自養生物固定CO2的主導途徑
2. 還原性TCA途徑：光合細菌和綠硫細菌
3. 還原的單羧酸循環
3.1.2 生物固氮
重要生化：僅次於光合作用的生物化學反應。
獨立固氮：原核微生物是唯一能固定分子氮的生物，為生物界主要氮源的來源途徑。
固氮原理：N2 ―> NH3
反應條件：與人工固氮相比，反應條件十分溫和。
3.1.3 二碳化合物的同化
代謝回補順序中的關鍵代謝物
三異：微生物不同或其碳源各異，則有不同的代謝回補順序,即種異、碳源異、代回異。
關鍵物：與EMP和TCA循環相關的回補順序有10條，而其中的關鍵中間代謝物為PEP(磷酸烯醇式丙酮酸)和OA（草酰乙酸)。
3.1.4 多糖的合成
1.單糖的合成
EMP途徑逆行合成葡萄糖－6－磷酸
2.多糖的合成
不僅僅是分解反應的逆行，而是以糖苷為起始物逐個將糖單位添加在多糖的末端。
3.1.5 氨基酸的合成
1.氨基化作用2.轉氨基作用3.前體轉化：由糖代謝中間產物合成
3.1.6 核苷酸的合成
1.嘌呤核苷酸的生物合成
（1）小分子化合物®次黃嘌呤核苷酸®嘌呤核苷酸
（2）堿基＋核苷®嘌呤核苷酸
2.嘧啶核苷酸的生物合成
（1）小分子化合物®尿嘧啶核苷酸®嘧啶核苷酸
（2）嘧啶/嘧啶核苷®嘧啶核苷酸
3.脫氧核苷酸的生物合成
核苷酸糖基第2位碳上的－OH還原為H而成。
3.2 其它耗能反應
1.細胞運動
細菌鞭毛的運動與ATP酶水解。
2.主動運輸
營養物質的跨膜運動。
3.生物發光
熒光色素酶。
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