1.標本的采集原則：嚴格的無菌操作，適宜時機和適當的部位，在抗生素使用之前采集，采樣後盡快送檢查及做好標記。
2.病原菌的檢測程序
（1）直接塗片鏡檢：凡在形態和染色性上具有特征的病原菌，可直接塗片染色後鏡檢，例如痰中查見抗酸性細長杆菌，多為結核杆菌。
（2）分離培養：無菌部位采取的血液、腦脊液等標本，可直接接種至營養豐富的液體或固體培養基。有正常菌群存在部位的標本應接種至選擇或鑒別培養基醫|學教育網搜集整理。
（3）生化試驗：如腸道杆菌不同菌屬間常采用生化試驗予以區別。
（4）血清學試驗：醫學教育|網搜集整理采用含有已知特異性抗體的免疫血清與分離培養出的未知純種細菌進行血清學試驗，可以確定病原菌的種或型。
（5）動物試驗：主要用於分離、鑒定病原菌，測定菌株產毒性等。
（6）藥物敏感試驗：對臨床選擇用藥有指導意義。
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