腹瀉為大便送檢的重要指征，嬰幼兒和小兒可見高熱驚厥。當疑為細菌性痢疾、腸炎、腸結核和頑固性腹瀉時，應在急性期采集，亦最好在用藥之前，以提高檢出率。腸熱症患者應在兩周以後采集理。采用自然排便法或直腸拭子法，挑取有膿血，粘液部位的糞便2～3g置於無菌容器中送檢。
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