小腸結腸炎耶爾森氏菌菌株根據其耐熱性和耐受高壓滅菌的菌體抗原能被血清學分型。
Wanters將小腸結腸炎耶爾森氏菌和相關菌歸納為54個血清群，Aleksii和Bockemuh等人提議將小腸耶氏菌的血清群簡化為18個群。
引起人類疾病的主要血清群是0:3,0:8,0:9和0:5,27。
我國以O3型為主，有毒菌株大多可以產生V和W抗原， 產生耐熱腸毒素。某些菌株的O抗原與人的組織具有共同的抗原，可以引起自身免疫性疾病。
傳播途徑
日常生活中以糞口傳播為主
該菌侵入機體後主要在腸粘膜繁殖，引起炎症和潰瘍，病變可擴展到腸係膜淋巴結。
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