麥康凱平板上小腸結腸炎耶爾森氏菌
大多數常用的腸道平板培養基都可以用於小腸結腸炎耶爾森氏菌的分離。在SS上於25℃經24 h培養，菌落細小，至48 h直徑才增大至0.5～3.0 mm。菌落圓整、光滑、濕潤、扁平或稍隆起，透明或半透明；在麥康凱瓊脂上菌落扁平、無色或者淡紅色，淡黃色，如若微帶紅色，則菌落中心的紅色常稍深。菌落直徑1～2 mm。
DHL平板上的小腸結腸炎耶爾森氏菌
在DHL瓊脂上菌落紅色，菌落中心的紅色更深，直徑1～2 mm。
SSK平板上的小腸結腸炎耶爾森氏菌
在SSK瓊脂上菌落深粉紅色，半透明，直徑2 mm
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