應按照生產商提供的使用說明進行免疫磁珠捕獲與分離。當生產商的使用說明與下麵的描述可能有偏差時，按生產商提供的使用說明進行。
將Eppendorff 管按樣品和質控菌株進行編號，每個樣品使用1 Eppendorff管，然後插入到磁板架上。在漩渦混合器上輕輕振蕩E.coli O157 免疫磁珠溶液後，用開蓋器打開每個Eppendorff 管的蓋子，每管加入20μLE.coli O157 免疫磁珠懸液。
取mEC+n 肉湯增菌培養物1mL，加入到Eppendorff 管中，蓋上蓋子，然後輕微振蕩10s。每個樣品更換1 隻加樣吸頭，質控菌株必須與樣品分開進行，避免交叉汙染。
結合：在18℃～30℃環境中，將上述Eppendorff 管連同磁板架放DynalMX1 樣品混合器上轉動或用手輕微轉動10min，使E.coli O157 與免疫磁珠充分接觸。
捕獲：將磁板插入到磁板架中濃縮磁珠。在3min 內不斷地傾斜磁板架，確保懸液中與蓋子上的免疫磁珠全部被收集起來，此時，在Eppendorff 管壁中間明顯可見圓形或橢圓形棕色聚集物。
吸取上清液：取1 支無菌加長吸管，從免疫磁珠聚集物對側深入液麵，輕
輕吸走上清液。當吸到液麵通過免疫磁珠聚集物時，應放慢速度，以確保免疫磁珠不被吸走。
免疫磁珠的滑落：某些樣品特別是那些富含脂肪的樣品，其磁珠聚集物易於滑落到管底。在吸取上清液時，很難做到不丟失磁珠，在這種情況下，可保留50μL～100μL 上清液於Eppendorff 管中。如果在後續的洗滌過程中也這樣做的話，脂肪的影響將減小，也可達到充分捕獲的目的。
洗滌：從磁板架上移走磁板，在每個Eppendorff 中加入1mL PBSTween20洗液，轉動磁板架3 次以上，洗滌免疫磁珠混合物。
免疫磁珠懸浮：移走磁板，將免疫磁珠重新懸浮在100μL PBS-Tween20 洗液中。
塗布平板
用漩渦混合器將免疫磁珠混勻，用加樣器各取50μL 免疫磁珠懸液分別轉移至CT-SMAC 平板和改良CHROMagar O157 顯色瓊脂平板一側，然後用無菌塗布棒將免疫磁珠塗布平板的一半，再用接種環劃線接種平板的另一半。待瓊脂表麵水分完全吸收後，翻轉平板，於36℃±1℃培養18h～24h
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