幾種常用的保藏方法：
1、傳代培養法
保藏的菌種通過斜麵、穿刺或皰肉培養基（用於厭氧細菌）培養好後，置4C˚冰箱中存放，定期進行傳代培養、再存放。
可用膠塞代替棉塞或在斜麵上覆蓋一層無菌液體石蠟來進一步延長保存期。
2、載體法
使生長合適的微生物吸附在一定的載體上進行幹燥。
常用的載體有土壤、砂土、矽膠、明膠、麩皮、磁珠和濾紙片等。
3、懸液法
將細菌、酵母菌細胞懸浮在一定的溶液中保存。
溶液包括蒸餾水、糖溶液、磷酸緩衝液、食鹽水等。
4、冷凍法
使菌種始終存放在低溫環境下的保藏方法。包括低溫法和液氮法。
此法關鍵是要克服細胞的冷凍損傷。注意控製降溫速率及保護劑的使用。
5、真空幹燥法
這類方法包括冷凍真空幹燥法和L－幹燥法。
冷凍真空幹燥法是將要保藏的微生物樣品先經低溫預凍，然後在低溫狀態下進行減壓幹燥。
L-幹燥法則不需要低溫預凍樣品，隻是使樣品維持在10－20C˚範圍內進行真空幹燥。
操作方法
1、斜麵保藏法
將菌種轉接在適宜固體斜麵培養基上，待其充分生長後，用牛皮紙將棉塞部分包紮好（棉塞換成膠塞效果更好），置4C˚冰箱中包藏。
保藏時間依微生物的種類而定。黴菌、放線菌及芽孢菌保存2－4個月移種一次，酵母菌間隔兩個月，普通細菌一個月，假單胞菌兩周傳代一次。
此法優點是操作簡單、使用方便，缺點是保藏時間短、易被汙染。
2、液體石蠟保藏法
將無菌石蠟加在已長好菌的斜麵上，其用量以高出斜麵頂端1CM為準，使菌種與空氣隔絕。
將試管直立，置低溫或室溫下保存。
此法實用且效果較好。黴菌、放線菌、芽孢菌可保藏兩年以上，酵母菌可保藏1－2年，普通細菌也可保藏1年左右。
3、穿刺保藏法
按穿刺接種方式培養菌種，菌種長好後用膠塞封嚴，置4℃冰箱存放。
4、砂土管保藏法
（1）河砂處理
取河砂若幹加入鹽酸10% ，加熱煮沸30min除去有機機質。倒去鹽酸溶液，用自來水衝洗至中性，最後一次用蒸鎦水衝洗，烘幹後用40目篩子過篩，棄去粗顆粒，備用。
（２）土壤處理
取非耕作層不含腐殖質的痩黃土或紅土，加自來水浸泡洗滌數次，直至中性。烘幹後碾碎，用100目篩子過篩，粗顆粒部分丟掉。
(3)砂土混合
處理妥當的河砂與土壤按3：1的比例摻合(或根據需要而用其他比例，甚至可全部作砂或土)均勻後，裝入10x100mm的小試管或安瓿管中，每管分裝1g左右，塞上棉塞，進行滅菌(通常采用間歇滅菌2--3次)，最後烘幹。
(4)無菌檢查
每10支砂土管隨機抽1支，將砂土倒入肉湯培養基中，30℃培養40h，若發現有微生物生長，所有砂土管則需重新滅菌，再作無菌試驗，直至證明無菌後方可使 用。
(5)菌懸液的製備
取生長健壯的新鮮斜麵菌種，加入2-3ml無菌水(每18x180mm 的試管斜麵菌種)，用接種環輕輕將菌苔洗下，製成菌懸液。
(6)分裝樣品
每支砂土管(注明標記後)加入0．5ml菌懸液(剛剛使砂土潤濕為宜)， 用接種針拌勻。
(7)幹燥
將裝有菌懸液的砂土管放入幹燥器內，幹燥器底部盛有幹燥劑。用真空泵抽幹水分後火焰封口(也可用橡皮塞或棉塞塞住試管口)。
(8)保存
置4℃冰箱或室溫幹燥處，每隔一定的時間進行檢測。此法多用於產芽孢的細菌、產生孢子的黴菌和放線菌。在抗生素工業生產中應用廣泛、 效果較好，可保存幾年時間，但對營養細胞效果不佳。
5、冷凍真空幹燥法
（1）凍幹管的準備：中性硬製玻璃，烘幹，滅菌。
（2）菌種培養：細菌芽孢脫落；放，黴孢子豐滿。
（3）保護劑的配製：配製，滅菌，檢查
（4）菌懸液的製備：2-3ml保護劑
（5）分裝樣品：菌懸液每管0.2ml
（6）預凍：程序控溫儀降溫
（7）冷凍真空幹燥：-50℃下抽真空
（8）取出樣品：輕敲鬆散即達標
（9）第二次幹燥：
（10）熔封
（11）存活性檢測：抽取一管進行存活性檢查
（12）保存：4℃保存
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