（1）工業潔淨室
以無生命微粒的控製為對象。主要控製空氣塵埃微粒對工作對象的汙染，內部一般保持正壓狀態。 它適用於精密機械工業、電子工業（半導體、集成電路等）宇航工業、高純度化學工業、原子能工業、光磁產品工業（光盤、膠片、磁帶生產）LCD（液晶玻璃）、電腦硬盤、電腦磁頭生產等多行業。
（2）生物潔淨室
主要控製有生命微粒（細菌）與無生命微粒（塵埃）對工作對象的汙染。又可分為：
A、一般生物潔淨室：主要控製微生物（細菌）對象的汙染。同時其內部材料要能經受各種滅菌劑侵蝕，內部一般保證正壓。實質上其內部材料要能經受各種滅菌處理的工業潔淨室。例：製藥工業、醫院（手術室、無菌病房）食品、化妝品、飲料產品生產、動物實驗室、理化檢驗室、血站等。
B、 生物學安全潔淨室：主要控製工作對象的有生命微粒對外界和人的汙染。內部要保持與大氣的負壓。例：細菌學、生物學、潔淨實驗室、物物工程（重組基因、疫苗製備）。
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