檢測實驗室應具有並應用評定測量不確定度的程序。應識別和證實不確定度分量處於控製之中，並評估處它們對結果的影響程度。
了解待檢微生物的分布情況，分樣時予以考慮。但建議不把這種不確定度包括在內，除非委托人有這方麵要求。
不確定度概念不能直接用於定性檢測結果。但應識別並證明個別的可變因素（如試劑的濃度）處於控製之中。對於判定限是一個重要的適用性指標的檢測而言，應慎重評估有關接種量的不確定度極其重要性。應意識到定性試驗中出現的假陰性和假陽性結果。
取樣
保證質量。
保持完整性，保證運輸和儲存條件，記錄運輸和儲存樣品的條件。
無菌取樣。檢測和記錄取樣地點的環境狀況（如空氣汙染、溫度等）。
樣品的處置和確認
檢查並記錄樣品狀況。
建立樣品傳遞、儲存、處置和識別管理程序。
避免汙染。
接樣後盡快進行樣品處理。
沒有特殊要求的，實驗室一般不保留樣品。
有嚴重汙染的樣品，去汙染後再廢棄。
記錄樣品有關信息（接收日期、樣品狀況等）。
適宜的樣品儲存條件。
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