1、平板劃線分離法
用接種環以菌操作沾取少許待分離的材料，在無菌平板表麵進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線 ，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養後，可在平板表麵得到單菌落。
2、稀釋倒平板法
3、單孢子或單細胞分離法
采取顯微分離法從混雜群體中直接分離單個細胞或單個個體進行培養以獲得純培養 。
在顯微鏡下使用單孢子分離器進行機械操作，挑取單孢子或單細胞進行培養。也可以采用特製的毛細管在載玻片的瓊脂塗層上選取單孢子並切割下來，然後移到合適的培養基進行培養。
4、選擇性培養基分離法
各種微生物對不同的化學試劑、染料、抗生素等具有不同的抵抗能力，利用這些特性可配製合適某種微生物而限製其它微生物生長的選擇培養基，用它來培養微生物以獲得純培養。
微生物純培養分離方法的比較
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