黴菌和酵母同屬於真菌。
黴菌：為絲狀真菌的統稱。凡是在營養基質上能形成絨毛狀、網狀或絮狀菌絲體的真菌（除少數外），統稱為黴菌。
按Smith分類係統，黴菌分屬於真菌界的藻狀菌綱 、子囊菌綱和半知菌類。
黴菌的分布：
在自然界分布相當廣泛，無所不在，而且種類和數量驚人。
在自然界中，黴菌是各種複雜有機物，尤其是數量最大的纖維素、半纖維素和木質素的主要分解菌。
一般情況下，黴菌在潮濕的環境下易於生長，特別是偏酸性的基質當中。
黴菌的應用：
生產各種傳統食品：如釀製醬、醬油、幹酪等。
工業應用：
生產有機酸（如檸檬酸、葡萄糖酸）、 酶製劑（如澱粉酶、蛋白酶和纖維素酶）、抗生素（如青黴素、頭孢黴素）、維生素、生物堿、真菌多糖、植物生長刺激素（如赤黴素）、生產甾體激素類藥物和釀造食品等，另外在生物防治、汙水處理和生物測定等方麵都有應用。
基本理論研究：黴菌在基本理論研究中應用很廣，最著名的是利用粗糙脈胞菌進行生化遺傳學方麵的研究。
黴菌的危害：
引起黴變：可造成食品、生活用品以及一些工具、儀器和工業原料等的黴變。
引起植物病害：真菌大約可引起3萬種植物病害。如水果、蔬菜、糧食等植物的病害。例如馬鈴薯晚疫病、小麥的麥鏽病和水稻的稻瘟病等等。
引起動物疾病：不少致病真菌可引起人體和動物病變。淺部病變如皮膚蘚菌引起的各種蘚症，深部病變如既可侵害皮膚、粘膜，又可侵犯肌肉、骨骼和內髒的各種致病真菌，在當前已知道的約5萬種真菌中，被國際確認的人、畜致病菌或條件致病菌已有200餘種（包括酵母菌在內）。
產生毒素，引起食物中毒：黴菌能產生多種毒素，目前已知有100種以上。例如：黃曲黴毒素，毒性極強，可引起食物中毒及癌症。
黴菌的菌體由分枝或不分枝的菌絲構成。
許多分枝菌絲相互交織在一起構成菌絲體。
菌絲是中空管狀結構，直徑約2-10µm。
黴菌菌絲類型：
按形態分：無隔菌絲：為長管狀單細胞，細胞質內含多個核。
其生長表現為菌絲的延長和細胞核的增多。
這是低等真菌所具有的菌絲類型。有隔菌絲
菌絲中有隔膜，被隔膜隔開的一段菌絲就是一個細胞，菌絲由多個細胞組成，每個細胞內有一至多個核。隔膜上有單孔或多孔，細胞質和細胞核可自由流通，每個細胞功能相同。這是高等真菌所具有的類型。按分化程度分:
營養菌絲（基內菌絲）:伸入到培養基內部，以吸收養分為主的菌絲。
氣生菌絲:向空中生長的菌絲.
氣生菌絲發育到一定階段可分化成繁殖菌絲.
黴菌的細胞結構
細胞壁：除少數低等水生黴菌細胞壁含纖維素外,大部分黴菌細胞壁主要由幾丁質組成.
幾丁質是由數百個N-乙酰葡萄糖胺分子以β-1，4糖苷鍵連接而成的。幾丁質和纖維素分別構成高等和低等黴菌細胞壁的網狀結構—微纖絲。微纖絲使細胞壁具有堅韌的機械性能。
組成真菌細胞壁的另一類成分為無定型物質，主要是一些蛋白質、甘露聚糖和葡聚糖，它們填充於上述纖維狀物質構成的網內或網外，充實細胞壁的結構。
黴菌的細胞膜、細胞核、線粒體、核糖體等結構與其他真核生物（如酵母）基本相同。
黴菌的菌落特征
菌落特征：黴菌的菌落大、疏鬆、幹燥、不透明，有的呈絨毛狀或絮狀或網狀等，菌體可沿培養基表麵蔓延生長，由於不同的真菌孢子含有不同的色素，所以菌落可呈現紅、黃、綠、青綠、青灰、黑、白、灰等多種顏色。
液體培養時的特征：
如果是靜止培養，黴菌往往在表麵上生長，液麵上形成菌膜。
如果是震蕩培養，菌絲有時相互纏繞在一起形成菌絲球，菌絲球可能均勻地懸浮在培養液中或沉於培養液底部。
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